Conception et réalisation d'un outil d'analyse et d'interprétation des données de puces à ADN : maeva

• Auteur / Autrice : Mory Doukoure
• Direction : Philippe Berta
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie santé. Sciences chimiques et biologiques pour la santé
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Montpellier 1
• Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université de Montpellier I. Faculté de médecine (1896-2014)

Mots clés

Mots clés contrôlés

Biotechnologie

Biologie informatique

Analyse de profil d'expression de gènes

Séquençage par oligonucléotides en batterie

Biotechnologie

Bioinformatique

Analyse

Expression génique

Filtres à ADN

Résumé

Depuis la fin des annees 1990, la technologie des puces a adn est en plein essor. Cette technologie permet d'analyser le transcriptome de facon global. Elle donne en effet l'opportunite d'etudier les variations transcriptionnelles a l'echelle du genome (plusieurs milliers de genes etudies simultanement). L'analyse et l'interpretation de ce grand nombre de donnees necessitent une approche bioinformatique performante. En effet, pour exploiter pleinement ce type de technologie, il faut faire appel a un grand nombre de disciplines : analyse d'image, technique de normalisation, analyse statistique des donnees, stockage et gestion des donnees, representation des donnees, regroupement / classification. . . La societe clinigenetics au sein de laquelle j'ai effectue ma these, utilise parmi d'autres, la technologie des puces a adn pour la decouverte de nouvelles cibles therapeutiques et de nouveaux traitements pour lutter contre les maladies cardiovasculaires. Mon role durant ma these a ete de selectionner des methodes d'analyses et les outils de visualisations intuitifs permettant de repondre aux objectif des etudes de transcriptomique de la societe. J'ai egalement participe a l'elaboration de la methodologie d'analyse et a l'interpretation des donnees generees par ces experiences.