Caractérisation d'une nouvelle famille de protéines susceptibles d'interagir avec une ARN polymerase plastidiale

Characterization of a new protein family interacting potentia lly with plastid NEP

• Auteur / Autrice : Jacinthe Azevedo
• Direction : Silva Lerbs-Mache, Florence Courtois, Thierry Lagrange
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance en 2005
• Etablissement(s) : Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015)

Résumé

Les ARN polymérases de type phagique, codées dans le noyau (NEP; Nuclear Encoded RNA Polymerase), assurent une partie de la transcrIption du génome plastidial des végétaux supérieurs. Ces travaux mettent en évidence l'existence d'une nouvelle famille de protéines d'A. Thaliana susceptibles d''interagir avec les NEP des plantes dicotylédones: les protéines NIP (NEP Interacting Protein). Les protéines NIP sont retrouvées uniquement dans le végétaux supérieurs et leur synthèse est dépendante de la lumière. Elles présentent un domaine d'interaction protéine-protéine RING fmger en C terminal. Nous avons montré pour la première fois par inununodétection que ces protéines sont intégrées aux membranes thylacoïdiennes et qu'elles retiennent probablement les NEP plastidiales à la surface de la membrane. Cette interaction avec les membranes pourrait apporter une nouvelle vision du fonctionnement des NEP dans le chloroplastes des plantes dicotylédones.

The phage-like RNA polymerases, encoded in the nucleus (NEP; Nuclear Encoded RNA Polymerase) ensure partial!y plastidial genome transcription in higher plants. This work underlined the existence of a new protein family potentially able to interact with NEP in dicotyledon plants: NIP proteins (NEP Interacting Protein). NIP proteins are only present in higher plants and their synthesis is light dependant. Their C-terminal region presents a RINC finger protein-protein interacting domain. Using immundetection, we show the first time that NIP proteins are integrated into thylakoid membranes, keeping probably NEP close to the membrane on the stroma side. This association to membranes offers new insights into NEP activity in chloroplasts of dicotyledon plants.