2005-07-05T23:59:59Z
2024-03-26T21:59:12Z
NMR study of internal dynamics of MUP-I
2005
2005-01-01
Les effets associés à la liaison du 2-(sec)-butyl-4,S-dihydrothiazole à la cavité hydrophobe de MUP-I ont été étudiés par les méthodes de relaxation RMN. L'influence du ligand sur la dynamique interne de la chaîne principale a été examinée par l'analyse des données de relaxation 15N. La relaxation par RMN BC des méthyles a été utilisée pour estimer l'impact de la liaison du ligand sur la dynamique interne des groupements méthyles. Ces études ayant uniquement montré des différences négligeables quant à la flexibilite des méthyles dans les formes libre et liées de la protéine. Les paramètres de relaxation dérivés des simulations DM ont été utilisés pour détecter les changements de dynamique interne des méthyles lors de la liaison du ligand.
The effects associated with binding the 2-(sec)-butyl-4,S-dihydrothiazole to the hydrophobie cavity inside MUP-I have been studied by NMR relaxation methods. The influence of the ligand on the backbone internai dynamics was examined by 15N NMR relaxation and its subsequent analysis. Side chain methylBC NMR relaxation has been used to asses the change of methyl internai motion upon the ligand binding. As a complementary technique, MD simulation derived relaxation parameters describing the motion of the methyl group axis, were used to detect changes of the methyl internai dynamics on the ligand binding.
Křížová, Hana
Marion, Dominique
Sklenář, Vladimír
Grenoble 1