Approches bioinformatiques et structurales des réplicases virales
par François-Patrice Ferron
Thèse de doctorat en Sciences de la vie et de la santé
Sous la direction de Bruno Canard.
Soutenue en 2005
à Aix-Marseille 2 , dans le cadre de Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille) , en partenariat avec Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (autre partenaire) .
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Résumé
La virologie bénéficie de plus en plus du développement de la bioinformatique. Mon projet de thèse recouvre la gestion de séquences de protéines se rapportant aux virus à ARN simple brin, de polarité négative et positive. J'ai mis en place une base de données VaZyMolO, qui gère les informations structurales et fonctionnelles des protéines, en définissant et en classant des modules. Cette approche a permis l'identification d'un domaine méthyltransférase sur la protéine L des Mononegavirales, et la définition de la modularité des protéines N et P des Paramyxoviridae. La cartographie du génome du virus du Syndrome Respiratoire Aigue Sévère réalisée à l'aide de VaZyMolO, a contribué à la résolution structurale de la protéine nsp9 de ce virus. Enfin, je présente une étude incluant évolution et analyse structurale des polymérases des Flaviviridae. Dans cette dernière, je propose un modèle de la polymérase du virus GBV-C et un mécanisme d'initiation de la synthèse d'ARN.
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Titre traduit
Bio-informatics and structural studies of RNA virus replicases
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Pas de résumé disponible.
Autre version
Cette thèse a donné lieu à une publication en 2005 par [CCSD] à Villeurbanne
Approches bioinformatiques et structurales des réplicases virales
