Thèse soutenue

Rôle de l'activité hydrolytique bactérienne dans le cycle de la matière organique en milieu marin : focus sur les enzymes lipase

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Auteur / Autrice : Nicolas Bourguet
Direction : Madeleine Goutx
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Microbiologie, biologie végétale et biotechnologies
Date : Soutenance en 2005
Etablissement(s) : Aix-Marseille 1
Partenaire(s) de recherche : Autre partenaire : Université de Provence. Section sciences

Mots clés

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Mots clés contrôlés

Résumé

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Après une étude bibliographique rappelant l'importance de l'activité ectoenzymatique bactérienne dans le cycle du carbone organique en milieu marin, ce manuscrit, ciblé sur l'étude du modèle lipides - lipases, présente les étapes qui ont permis de mettre au point un protocole fournissant des mesures réalistes de l'activité lipase des bactéries marines en suivant la dégradation d'un substrat triglycéride radioactif : la [3H]-trioléine. Au cours d'une étude dans le lagon de Nouvelle-Calédonie, cette nouvelle technique a été comparée avec la technique traditionnelle qui utilise des analogues fluorescents, et s'est révélée être plus spécifique, sensible et reproductible. Puis, comparée aux mesures chimiques de l'hydrolyse d'un triglycéride au cours d'une expérience de biodégradation in vitro, elle s'est avérée refléter de manière significative l'activité lipase s'exerçant in situ. Suite à ces deux étapes de validation, ce protocole a été utilisé au cours d'une étude environnementale en Méditerranée nord-occidentale dans le cadre du projet PROOF-PROPECHE, notamment pour mettre en évidence le rôle joué par l'hydrolyse ectoenzymatique dans l'accumulation de carbone organique dissous au cours de la transition printanière du milieu vers l'oligotrophie