Etude structurale par RMN de la protéine v-Myb

Structural studies of the v-Myb protein by NMR

• Auteur / Autrice : Didier Rivière
• Direction : Daniel Davoust
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie - Physique
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Rouen

Mots clés

Mots clés contrôlés

Différenciation cellulaire

Spectroscopie de la résonance magnétique nucléaire

Protéines -- Analyse

Protéines de liaison à l'ADN

Virus oncogènes à ADN

Résumé

Les protéines Myb sont des facteurs de transcription capables de contrôler la différentiation et la prolifération cellulaire. Il ne fait aujourd'hui aucun doute que les activités importantes des protéines Myb sont déterminées par leurs domaines fonctionnels. La spectroscopie RMN hétéronucléaire multidimensionnelle a été utilisée pour étudier le domaine de liaison minimale à l'ADN de la protéine v-Myb (R2R3 v-Myb) en phase aqueuse. Nous avons ainsi attribué la quasi-totalité de cette protéine. A l'aide des effets structurants secondaires, nous avons pu estimer les régions hélicoi͏̈dales de cette protéine. Comme pour toutes les protéines Myb étudiées structuralement jusqu'à présent, la répétition R3 de ce domaine présente effectivement trois hélices ? entre les résidus Glutamate 62 - Leucine 75, Tryptophane 79 - Lysine 84, Thréonine 91 - Sérine 100. Mais le domaine R2 de cette protéine semble avoir une structuration différente que celle déjà observées pour d'autres protéines Myb (C-Myb humain/poulet et B-Myb poulet). Ces protéines présentaient en effet une structuration en conformation multiple en partie C-Terminal de ce domaine alors que notre étude nous montre une structuration effective en hélice ? de cette région. Cette structuration avait déjà été observée pour la protéine C-Myb souris. La structuration de notre protéine se rapprocherait donc plus de celle mentionnée pour cette dernière. Il semble donc que la structure seule de ces protéines n'explique pas les différences d'activités biologiques observées pour v-Myb par rapport aux autres protéines Myb (notamment C-Myb souris).

The Myb proteins are transcription factors able to control the differentiation and the cellular proliferation. There is not any doubt today that the important activities of the Myb proteins are determined by their functional domains. Multidimensional heteronucléaire NMR spectroscopy has been used to study the minimal v-Myb DNA binding domain (R2R3 v-Myb) in solution. We assigned 103 of 105 residues of this protein. Using the secondary structural effects, we could estimate the helicoidals regions of this protein. As for all the Myb proteins structurally studied until now, the R3 repetition of this protein present indeed three alpha helix between residues Glutamate 62 - Leucine 75, Tryptophane 79 - Lysine 84, Thréonine 91 - Sérine 100. But the R2 repeat of this protein seems to have a structuring different that already observed for other proteins Myb (C-Myb human/chicken and B-Myb chicken). Theses proteins contain a multiple conformational structure in C-Terminal of this domain whereas our study show an effective helix ? in this region. This result had already been observed for the protein C-Myb mouse and the v-Myb structure would approach more the structure of this protein. It would seem that the structure does not explain the differences in biological activities observed for v-Myb compared to the other proteins Myb (in particular C-Myb mouse).