Cartographie fine et caractérisation d'un QTL localise sur le chromosome 7 porcin et affectant les caractères de croissance et d'engraissement

• Auteur / Autrice : Olivier Demeure
• Direction : Denis Milan
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biochimie. Biologie moléculaire et cellulaire
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : École nationale supérieure agronomique de Rennes (1961-2004)

Mots clés

Mots clés libres

QTL, porc, engraissement, cartographie compare, Backcross

Résumé

Cette étude a porté sur la cartographie fine et la caractérisation d'un QTL affectant la croissance et l'engraissement des porcs. Ces deux caractères ont un intérêt économique important et une meilleure appréhension de leur déterminisme permettra de faire progresser les schémas de sélection. Au début des années 1990, l'INRA a réalisé une primo localisation des QTL affectant les caractères de croissance et d'engraissement chez le porc à l'aide d'un programme de type F2 (Large White x Meishan) appelé PorQTL. Parmi les autosomes, le QTL présentant les effets les plus importants a été localisé sur le chromosome 7, dans la région du SLA. Contrairement aux autres QTL détectés, pour le chromosome 7 c'est la race Meishan (race grasse) qui est associée à de meilleures performances. De plus, les allèles au QTL de cette race présentent une dominance sur les allèles de la race Large White. A l'issue du programme, le QTL était localisé dans un intervalle de 15 cM, sans que l'on sache si un o plusieurs gènes étaient responsables des effets observés, ni même si le QTL était fixé dans la race Meishan. Plusieurs approches ont été utilisées pour tenter de répondre à ces questions : -la première a consisté a caractériser les haplotypes en étudiant les évolutions de fréquence des allèles dans des lignées synthétiques commerciales soumises à une sélection. Cette stratégie a confirmé les résultats précédemment obtenus avec le programme PorQTL et mis en évidence l'existence d'un haplotype spécifique de la race Piétain dont les effets pourraient être supérieurs à ceux associés à la race Meishan

The aim of this study was to cartography and characterize a QTL affecting growth and fatness traits in pigs. Those two traits have an important economic interest and better knowledge of their determinism should permit a selection schemes progress. At the beginning of the 1990's the INRA institute realized a primo-localisation of the QTL affecting pig growth and fatness traits based on an F2 programm (Large White x Meishan) caller PorQTL. For the autosomes, the QTL with the most important effects has been localized on the chromosome 7, close to the SLA. Contrary to the other QTL, the SSC7 QTL's best performances are associated with the Meishan breed (fat bree). Moreover, those breed QTL alleles present a dominance over the Large White alleles. Based on this program, the QTL was localized in a 15 cM interval but we did not know if the observed effects were due to one or several genes, nor if there was a fixation of the QTL in the Meishan breed. Different strategies were applied to answer those questions : - the first one has consisted in a characterization of the haplotypes by studying the evolution of the alleles frequency in synthetic lines under selection. This strategy confirmed the previous results obtained with the PorQTL program and revealed a Pietrain specific haplotype which effects might be higher than those associated with the Meishan breed. - the development of a tree generation backcross protocol has permitted to reduce the QTL localisation interval from 15cM to 5. 6 cM