Cartographie génétique et cytogénétique chez le bananier : caractérisation des translocations

Genetic and cytogenetic mapping in bananas : characterization of translocations

• Auteur / Autrice : Alberto Duarte Vilarinhos
• Direction : Angélique D'Hont
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie intégrative
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Montpellier, ENSA

Mots clés

Mots clés contrôlés

Translocation (génétique)

Bananes

Bananiers

Mots clés libres

Bac-fish

Cartographie génétique

Cartographie cytogénétique

Résumé

L'objectif de cette thèse était de mettre au point l'hybridation in situ fluorescente de clones BAC (BAC-FISH) chez le bananier pour caractériser les translocations, en particulier entre les accessions diploïdes Musa acuminata 'Calcutta 4' et 'Madang'. Cela a impliqué la construction d'une banque BAC de 'Calcutta 4' qui comprend 55152 clones et couvre 9 fois le génome nucléaire, et la construction d'une carte génétique à partir d'une population F2 'Calcutta 4' x 'Madang'. Cette carte comprend 120 marqueurs et 14 groupes de liaison. Les BACs correspondants à quatre marqueurs répartis sur le groupe de liaison II ont été localisés par BAC-FISH sur les chromosomes de 'Calcutta 4' et 'Madang'. Les résultats montrent que ces marqueurs impliqués dans le GUI appartiennent à trois paires de chromosomes dont la structure diffère entre 'Madang' et 'Calcutta 4' par la présence de deux translocations liées chez 'Calcutta 4'. Une carte cytogénétique globale de 'Calcutta 4' a également été initiée.

The objective of this thesis was to establish a tool based on the in situ hybridization of BAC clones (BAC-FISH) to characterize translocation break points in bananas especially between two diploid accessions of Musa acuminata, 'Calcutta 4' and 'Madang'. To attempt this objective a 'Calcutta 4' BAC library having 55. 152 and covering 9 x the banana's genome was developed. A genetic map was built based on a F2 population from 'Calcutta 4' x 'Madang', it en compasses 120 markers distributed in 14 linkage groups. Four BAC clones corresponding to 4 genetic markers distributed on LG II were localized on the 'Calcutta 4' and 'Madang' chromosomes. The results show that the markers involved in the LG II are localized on three different chromosomes, the structure of these chromosomes being different between 'Calcutta 4' and 'Madang' by the presence of the two linked translocations in 'Calcutta 4'. We have also initiated a global cytogenetic map of the accession 'Calcutta 4