Synthèse de PNA cycliques courts ciblant des boucles des ARN du VHC et du VIH-1 : activité antivirale et pénétration cellulaire

Synthesis of small cyclic PNA-based compounds targeting HCV and HIV-1 RNA loops : antiviral activity and cellular uptake

• Auteur / Autrice : Sergio Caldarelli
• Direction : Roger Condom
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Chimie
• Date : Soutenance en 2004
• Etablissement(s) : Nice
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences fondamentales et appliquées (Nice ; 2000-....)

Mots clés

Mots clés contrôlés

ARN

Inhibiteurs

VIH (virus)

Virus de l'hépatite C

Résumé

Dans le cadre de la recherche de nouveaux anti-viraux, des séquences hautement conservées de l’ARN génomique du VHC, structurées en tige-boucle, représentent des cibles thérapeutiques compte tenu de leur implication dans la réplication virale. Dans ce contexte, nous avons envisagé d’inhiber le rôle joué par le domaine IV de l’IRES au moyen d’un PNA antisens cyclique complémentaire, via la formation d’un complexe « boucle-boucle » de haute affinité. D’autre part, nous avons élaboré un conjugué de fluorescéine et d’un PNA cyclique complémentaire d’une boucle de l’ARN du VIH-1, afin d’étudier la pénétration cellulaire de ce type de composés. Les PNA cycliques ont été synthétisés en phase liquide, suivant des stratégies originales. Les études biologiques ont mis en évidence que le PNA cyclique dirigé contre la boucle IV de l’IRES inhibe la fonction de ce dernier. De plus, les études de pénétration cellulaire ont montré que les PNA cycliques ne traversent pas les membranes biologiques.

Within the framework of an antiviral drug development, highly conserved stem-loop RNA sequences of the HCV genome represents therapeutic targets in the light of their involvements in essential steps of the viral life cycle. In this context, a cyclic molecule including a heptameric PNA sequence has been designed and synthesised in order to target the loop of the IRES domain IV of HCV through the formation of a “kissing complex”. In addition, a fluorescently labeled cyclic PNA, complementary of a HIV-1 RNA loop, has been prepared in order to investigate the cellular uptake of such compounds. The synthesis of the cyclic PNAs has been accomplished following original liquid-phase strategies. The biological studies showed that the cyclic PNA directed against the IRES stem-loop IV displayed an inhibitory activity of the IRES function. Moreover, the cellular uptake investigation showed that the cyclic PNA do not enter cells.