Thèse soutenue

Acquisition incrémentale et représentation des systèmes intégrés bactériens par une approche orienté-objet

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Auteur / Autrice : Julie Chabalier
Direction : Gwennaële FichantCécile Capponi
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Informatique et mathématiques
Date : Soutenance en 2004
Etablissement(s) : Aix-Marseille 1
Partenaire(s) de recherche : autre partenaire : Université de Provence. Section sciences

Résumé

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Dans le cadre de l'étude des interactions entre les objets biologiques, nous avons développé ISYMOD, un environnement informatique de représentation, d'acquisition, et d'exploitation des connaissances sur les systèmes intégrés bactériens. Une base de connaissances de domaine modélise les systèmes biologiques, par un ensemble de classes et d'associations, organisées hiérarchiquement. Pour assurer la cohérence globale de la base, nous avons intégré dans le système de représentation, un algorithme de propagation de la classification. L'analyse des systèmes intégrés est représentée au sein d'une base de connaissances méthodologiques extensible, à travers des problèmes décrits et hiérarchisés, des méthodes exécutables, et des stratégies de résolution associant problèmes et méthodes. La co-existence des deux bases dans un même environnement permet un contrôle du flux de données entre les étapes incrémentales d'analyse et de stockage, même en cas d'évolution du schéma des bases.