Recherche de gènes d'intérêt chez le cheval : cartographie intégrée et mise en évidence de la mutation causale de l'épidermolyse bulleuse jonctionnelle

Identification of genes of interest in horse : development of a comparative map and identification of the causal mutation responsible of junctional epidermolasis bullosa

• Auteur / Autrice : Dragan Milenkovic
• Direction : Gérard Guerin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Génétique
• Date : Soutenance en 2003
• Etablissement(s) : Versailles-St Quentin en Yvelines

Mots clés

Mots clés contrôlés

Génétique

Vieillissement

Cheval

Expression génique

Mutation (biologie)

Épidermolyse bulleuse simple

Résumé

Le premier volet de thèse a consisté à enrichir le génome équin en marqueurs afin d'obtenir une carte comparative et intégrée. Des clones de BAC équins et caprins contenant les gènes identifiés ont été localisés sur les chromosomes par FISH. 136 gènes ont été localisés sur la carte cytogénétique. La comparaison de l'ordre des gènes entre le cheval et l'homme a permis d'identifier des remaniements dans leurs ordres. Pour densifier la carte génétique et d'hybrides irradiés, nouveaux microsatellites équins ont été recherchés. Egalement, la mutation causale responsable de l'épidermolyse bulleuse jonctionnelle (EBJ) dans des races de trait en France a été recherchée. Une mutation, l'insertion d'une cytosine dans le gène LAMC2, s'est avérée responsable d'EBJ chez les Trait Breton et Comtois ainsi que chez les Trait Belge, suggérant l'existence d'un effet fondateur. L'identification de la mutation causale a permis de développer un test moléculaire pour le génotypage des animaux à partir d'ADN.

The first part of thesis consisted to enrich the equine genome with markers and obtain comparative and integrated maps. Equine and caprine BAC clones containing identified genes were localised on horse chromosomes by FISH. 136 genes were so localized on the cytogenetic map. The comparison of order of genes between the horse and human allowed identification of rearrangements in their order. The genetic and radiation hybrid maps were enriched with new microsatellites. Also, the causal mutation responsible for junctional epidermolysis bullosa (JEB) in France draft horse breeds was search. A mutation, insertion of cytosine in LAMC2 gene, was identified as responsible for JEB in Breton and Comtois draft horses as well as in Belgian horses, suggesting the existence of a common ancestor. Identification of the causal mutation made it possible to develop a molecular test for genotyping and identification of healthy carriers.