Systématique et évolution des rongeurs du groupe Praomys (Rodentia, Murinae)

• Auteur / Autrice : Emilie Lecompte
• Direction : Christiane Denys
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Zoologie
• Date : Soutenance en 2003
• Etablissement(s) : Paris, Muséum national d'histoire naturelle
• Ecole(s) doctorale(s) : École doctorale Sciences de la nature et de l'Homme - Évolution et écologie (Paris ; 1995-....)
• Jury : Examinateurs / Examinatrices : Pascal Tassy, Peter John Taylor, Erik Van der Straeten
• Jury : Rapporteurs / Rapporteuses : François Catzeflis, Guy Graham Musser

Mots clés

Mots clés contrôlés

Évolution

Génétique

Afrique

Populations

Analyse cladistique

Praomys

Résumé

La systématique et l'évolution de la sous-famille des Murinae posent de nombreux problèmes. L'Afrique apparaît comme un centre d'endémisme important pour ces rongeurs, mais l'origine et les modalités de la radiation murine sur ce continent restent mal connues. Le groupe Praomys apparaissait comme un modèle de choix pour l'étude des modalités de peuplement murin de l'Afrique du fait d'une diversité importante, de son abondance dans les communautés de rongeurs ainsi que par sa présence dans tous les biotopes subsahariens. Une approche intégrative, combinant des données chromosomiques, morphologiques et moléculaires a été menée. Le séquençage du gène mitochondrial cytochrome b et d'un fragment du gène nucléaire IRBP a permis l'obtention d'une phylogénie robuste. La confrontation des phylogénies morphologiques et moléculaires et l'intégration des données paléontologiques, biochimiques et cytogénétiques ont permis de mettre en évidence la monophylie d'un ensemble formé par les genres africains du groupe Praomys et la paraphylie de la plupart des genres de ce groupe, témoignant de phénomènes de convergence importants. Ceci a également permis de réviser la classification du groupe. Ces résultats ont permis de proposer un cadre spatio-temporel à l'évolution des Murinae et du groupe Praomys. La radiation des Murinae en Afrique se serait faite à partir d'Asie, par au moins trois vagues de dispersion et la radiation des genres du groupe Praomys se serait produite à la fin du Miocène vers 7 à 9 Ma

[The systematics and evolution of Murinae pose many problems. Africa appears as an important endemism center for these rodents, but the origin and the modalities of the murine radiation on this continent remains uncertain. The Praomys group appears as a good model for the study of the Africa population modalities by Murinae, because of its important diversity, its abundance in rodent communities, as well as its presence in all sub-Saharan biotopes. An integrative approach, combining chromosomal, morphological and molecular data have been carried out. The sequencing of the cytochrome b mitochondrial gene and a portion of the IRBP nuclear gene allowed a robust phylogeny production. The confrontation of the morphological and molecular phylogenies, with the integration of paleontological, biochemical and cytogenetical data allowed to highlight the monophyly of a group comprising the African genera of the Praomys group, as well as the paraphyly of most of its genera, showing important convergence phenomena. Also, this allows to review the Praomys group systematics. These results allow to propose a spatio-temporal framework for the Murinae evolution, and in particular for the Praomys group. Thus, the Murinae radiation in Africa would have been resulted of, at least, three dispersion stages, probably issued from Asia. The different lineages within the Praomys group probably result from an adaptive radiation at the end of the Miocene, about 7-9 Myr]