Étude des processus d'épissage alternatifs et de polyadénylation impliqués dans le polymorphisme de longueur de la région 3' non traduite des ARNm DQA1

Study of the alternatives splicing and polyadenylation processes involved in the length polymorphism of the 3' untranslated region of DQA1 mRNAs

• Auteur / Autrice : Jean-Jacques Hoarau
• Direction : Frédéric Cadet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biochimie et biologie moléculaire
• Date : Soutenance en 2002
• Etablissement(s) : La Réunion

Mots clés

Mots clés contrôlés

Polyadénylation

Antigènes de classe II

Épissage (génétique)

Régulation génétique

ARN messagers

Polymorphisme génétique

Résumé

L'objectif de ce travail a été d'identifier et de caractériser les mécanismes à l'origine du polymorphisme de longueur, affectant essentiellement la région 3' non traduite des ARNm DQA1. L'ADN génomique de sept allèles DQA1 a, tout d'abord, été séquencé. Un site d'épissage canonique donneur (AG/GTA) et trois séquences accepteurs ont été identifiés, ainsi que trois signaux de polyadénylation. Par la suite, les ARNm cycloplasmiques des sept lignées cellulaires B homozygotes ont été quantifiés par une méthode de RT-PCR semi-quantitative. Les résultats montrent que le polymorphisme de longueur de la région 3' non traduite des ARNm DQA1 résulte de la combinaison des processus d'épissage et de polyadénylation alternatifs. Cinq, sept et huit isoformes d'ARNm ont été respectivement détéctés dans les groupes d'allèle [*0101, *0102, *0103], [*0201, *0301] et [*0401, *0501]. Le taux de chaque isoforme d'ARNm DQA1 est également corrélé au polymorphisme des séquences d'épissage et de polyadénylation.