Etude de l'étiologie de maladies de dégénérescence des arbres fruitiers tempérés : caractérisation de nouveaux agents viraux associés aux genres Nepovirus et Foveavirus

• Auteur / Autrice : Pascal Gentit
• Direction : Thierry Candresse
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie moléculaire et cellulaire végétale
• Date : Soutenance en 2001
• Etablissement(s) : Toulouse, INPT

Mots clés

Mots clés contrôlés

Pêcher

Maladies

Cerisier

Nepovirus

Virus à ARN bicaténaire

Phytovirus

Résumé

Plusieurs éléments d'informations ont été apportés sur l'étiologie de maladies des arbres fruitiers tempérés. Quatre agents viraux et plusieurs souches ou variants ont été caractérisés, soit par des techniques d'étude basée sur l'identification et la recherche directe de l'agent pathogène soit en utilisant des techniques moléculaires non spécifiques qui s'adressent à la forme réplicative des phytovirus à ARN simple brin : les ARNs bicaténaires (ARNdb). Par une approche traditionnelle, nous avons identifié un nouveau virus infectant naturellement l'abricotier. Le respect des postulats de Koch permet de définir l'Apricot latent ringspot virus comme appartenant au sous-groupe C du genre Nepovirus responsable de la maladie des taches annulaires latente de l'abricotier. A partir des ARNdb extraits de pêchers GF305 infectés, nous avons identifié deux isolats viraux, LA2 et Caserta 12, associés à deux maladies d'étiologie inconue : la maladie des anneaux de suie du pêcher (peach sooty ringspot) et la maladie de la moucheture étoilée du pêcher (peach asteroid spot). Les informations partielles de séquences obtenues sur ces deux agents montrent qu'ils sont proches d'un virus du genre Foveavirus, l'Apricot latent virus. De la même façon en utilisant les ARNdb extraits de tissus de pêchers infectés par la marbrure nécrotique du cerisier (cherry necrotic mottle leaf), nous avons pu y associer deux virus, P1A et P1B, caractérisés et présents en infection mixte dans un des isolats, P1C124. Le virus P1A, cloné et séquencé dans sa totalité, est un nouvel isolat du cherry green ring mottle virus tandis que l'analyse de l'extrémité 5' de l'isolat P1B indique qu'il s'agit vraisemblablement d'une souche du Cherry necrotic rusty mottle virus. Tous ces virus appartiennent au nouveau genre de virus filamenteux les Foveavirus. Deux autres maladies ont également été abordées au cours de ce travail, la maladie de la crosse nécrotique du cerisier (cherry necrotic crook) et la maladie de la marbrure du cerisier (cherry mottling). Pour cette dernière nous avons pu mettre en evidence la présence d'ARNdb spécifiques de l'infection.