Etudes structurales par RMN d'une protéine impliquée dans la répression catabolique des sucres et d'un complexe drogue-ADN

par Adrien Favier

Thèse de doctorat en Physique

Sous la direction de Dominique Marion.

Soutenue en 2001

à l'Université Joseph Fourier (Grenoble) .

    mots clés mots clés


  • Résumé

    La structure en solution de B. Subtilis Crh, une protéine du system de répression catabolique a été déterminée par RMN. Crh possède une importante identité de séquence avec HPr, une phosphoprotéine du système phosphoénolpyruvate (PEP) : carbohydrate phosphotransférase également impliquée dans la régulation catabolique des sucres chez les bactéries à Gram +. Nous avons montré que Crh forme un mélange monomère/dimère alors que HPr est monomérique. Une attribution complète de la forme monomérique de Crh a été obtenue ainsi que 60 % des résonances du squelette peptidique du dimère ; permettant l'identification de l'interface du dimère par cartographie des déplacements chimiques. Les structures des monomères de Crh et de HPr sont proches, mais possèdent des différences significatives dont un décalage de deux résidus dans l'appariement du feuillet [bêta] qui pourrait avoir une influence sur les natures oligomériques différentes des deux protéines. L'importante conservation des résidus de surface entre Crh et HPr au niveau du site de liaison de HPr pour leur partenaire protéique commun CcpA ainsi que la similitude des propriétés dynamiques des deux phosphoprotéines suggère que les surfaces d'interaction de Crh et de HPr pour CcpA sont semblables. Au cours d'une seconde étude, nous avons résolu la structure en solution d'un complexe composé du fragment d'ADN d(CGATCG)2 et une nouvelle drogue antitumorale en cours de développement. Les cycles aromatiques de la drogue s'intercalent entre les paires de base GC, et la chaîne latérale de l'intercalant interagit avec le petit sillon de l'ADN. Des simulations de dynamique moléculaire sans contrainte dans une boîte d'eau ont confirmé la stabilité du modèle d'intercalation. La structure de ce complexe contribue à une meilleure compréhension des mécanismes d'interaction drogue/ADN permettant de rationaliser la mise au point de la génération suivante d'agents anticancéreux.

  • Titre traduit

    Structural studies of a protein involved in the catabolite repression of sugars and a drug-DNA complex by NMR


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  • Détails : 1 vol. (158 p.)
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  • Bibliothèque : Université Grenoble Alpes (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque et Appui à la Science Ouverte. Bibliothèque universitaire Joseph-Fourier.
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  • Bibliothèque : Université Grenoble Alpes (Saint-Martin d'Hères, Isère). Bibliothèque et Appui à la Science Ouverte. Bibliothèque universitaire Joseph-Fourier.
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