Etude par rmn des interactions entre proteines et partenaires biologiques : determination de la structure des complexes alcr-adn et capsiceine-sterol et etude de r1b, un motif de liaison a l'arn

• Auteur / Autrice : BERTRAND CAHUZAC
• Direction : Eric Guittet
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques fondamentales et appliquées
• Date : Soutenance en 2000
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Les proteines sont des molecules indispensables au fonctionnement des cellules vivantes. Comme leur fonction depend surtout de leur structure tridimensionnelle, la connaissance de ces structures seules, et mieux en interaction avec les ligands biologiques, permet de mieux comprendre leur activite biologique. Ce manuscrit est consacre a l'etude structurale par rmn de trois systemes biologiques differents. Le premier systeme etudie est un activateur transcriptionnel du champignon aspergillus nidulans, alcr. Le domaine de liaison a l'adn, alcr(1-60), presente de nombreuses particularites. La structure a haute resolution a ete determinee au cours de cette these, par rmn multidimensionnelle et modelisation moleculaire. Cette structure est caracterisee par la presence de 4 helices alpha. Puis une structure bien resolue d'un complexe entre alcr et une cible nucleotidique a ete obtenue. Cette structure a permis de proposer des explications satisfaisantes aux particularites fonctionnelles d'alcr. Afin de mieux caracteriser cette structure. De nombreuses experiences rmn ont ete menees, notamment l'etude de l'orientation spontanee du complexe dans le champ magnetique. Le deuxieme systeme etudie est celui de r1b, un element repete de la glutamyl-prolyl-arnt-synthetase du mammifere cricetullus griseus (51 acides amines). La structure est composee de deux helices disposees en rouleau superenroule antiparallele, dont une boucle omega verrouille l'extremite. L'analyse de cette structure a permis d'assigner a r1b une fonction generale de liaison aux arns. Le troisieme systeme etudie concerne la capsiceine, une elicitine secretee par le champignon phytophthora capsicii. Nous avons pu dans ce manuscrit determiner la structure tridimensionnelle du complexe capsiceine-ergosterol. Cette structure montre que le sterol vient se loger dans une cavite hydrophobe situee au cur de la proteine.