Etude des mecanismes de regulation de l'epissage alternatif des arn pre-messagers : analyse de la specificite d'action des facteurs riches en serine/arginine

• Auteur / Autrice : Cyril Bourgeois
• Direction : James Stévenin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées
• Date : Soutenance en 1999
• Etablissement(s) : Strasbourg 1

Résumé

Chez les eucaryotes superieurs, l'epissage alternatif constitue un mode couramment utilise pour la regulation de l'expression des genes. La famille des proteines sr (riches en serine/arginine) est composee d'au moins une dizaine de membres, qui possedent des fonctions importantes et redondantes au cours de l'epissage constitutif, mais aussi des fonctions plus specifiques dans la regulation de l'epissage alternatif. Ces proteines sont constituees d'un domaine de liaison a l'arn en n-terminal et d'un domaine riche en arginines/serines en c-terminal (le domaine rs). Nous avons etudie les bases moleculaires a l'origine de la specificite d'action des proteines sr. Nos resultats montrent que les proteines sr 9g8, sc35, asf/sf2 et srp20 sont capables de reconnaitre tres specifiquement leurs sequences-cibles d'arn dans un extrait nucleaire. 9g8, qui possede un doigt a zinc, peut reconnaitre deux types de sequences d'arn differentes, selon que le doigt a zinc est implique ou non dans l'interaction. Enfin, nous demontrons que les sequences identifiees sont fonctionnelles en tant qu'activateurs d'epissage in vitro, et que les proteines sr correspondantes peuvent transactiver un epissage de maniere sequence-specifique. Nous avons egalement recherche les elements regulant en cis l'epissage alternatif de l'unite e1a d'adenovirus. Nous identifions un nouveau type de sequence possedant une activite bidirectionnelle in vitro et in vivo, qui active alternativement la reconnaissance d'un intron en amont ou du site donneur d'epissage situe juste en aval. Cet element est reconnu par plusieurs proteines sr differentes, qui possedent des capacites activatrices distinctes sur les deux reactions alternatives.