Cartographie du genome canin : construction de la premiere carte d'hybrides d'irradiation

• Auteur / Autrice : CATHERINE MOINARD PRIAT
• Direction : Francis Galibert
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Biologie
• Date : Soutenance en 1999
• Etablissement(s) : Rennes 1

Résumé

En genetique, construire la carte d'un genome consiste a baliser les chromosomes le composant par des reperes, les marqueurs. Plus une carte est dense en marqueurs regulierement espaces, plus elle est informative et donc plus les applications ulterieures sont nombreuses. Parmi les differentes strategies de cartographie, celle exploitant les hybrides d'irradiation presente de nombreux avantages. Ainsi, des marqueurs polymorphes tels que les microsatellites, utiles pour les analyses de liaison genetique, et des marqueurs de genes, permettant d'etablir des cartes comparees avec d'autres genomes, pourront etre localises sur une seule et meme carte par cette methode. Une telle carte permettra non seulement l'identification de genes d'interets mais egalement l'etude de l'evolution des genomes. Parmi les mammiferes, le chien constitue un modele genetique particulierement interessant, notamment en pathologie comparee puisque chacune des multiples races canines, bien qu'appartenant a une seule et meme espece, est specifiquement affectee par des maladies genetiques particulieres frequemment similaires a celles rencontrees chez l'homme. De meme, les caracteres physiques et comportementaux, facilement identifiables chez le chien, sont specifiques d'une race donnee. Disposer d'une carte du genome canin permettrait donc d'identifier des genes impliques dans des traits phenotypiques, comportementaux ou pathologiques, tant chez l'homme que chez l'animal. Dans cet objectif, la cartographie du genome canin par hybrides d'irradiation a ete entreprise au laboratoire. Mon travail de these au sein de ce projet a consiste, dans un premier temps, a caracteriser un ensemble de 400 marqueurs microsatellites et 463 marqueurs de genes, canins ou orthologues. Puis, dans un second temps, la cartographie de 400 de ces marqueurs, grace a un panel d'hybrides d'irradiation construit au laboratoire, a constitue la premiere carte d'hybrides d'irradiation du genome canin, egalement la premiere carte canine presentant un nombre aussi important de marqueurs. A partir de celle-ci, les avancees en matiere de cartographie et d'analyse du genome du chien, tant au laboratoire que dans d'autres equipes, ont permis d'accelerer considerablement la decouverte de nouveaux genes, au plan international. Ainsi, grace a de tels projets de cartographie, l'interet du modele genetique canin est en plein essor.