Variations sur l'impact des processus démographiques sur la diversité génétique

• Auteur / Autrice : Frédéric Austerlitz
• Direction : Pierre-Henri Gouyon
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques fondamentales et appliquées
• Date : Soutenance en 1999
• Etablissement(s) : Paris, ENGREF

Résumé

La genetique des populations soumises a des variations demographiques ne s'est developpee que recemment. Nos travaux ont vise a etudier divers cas ou l'on se trouvait face a une situation de changement demographique recent (fondation, recolonisation). Normalement, dans ces cas, on s'attend a un effet fondateur : une forte perte de diversite genetique dans ces populations nouvellement fondees. Nous nous sommes interesse plus particulierement aux arbres forestiers des regions temperees et a une population humaine de canadiens-francais recemment fondee. Dans le premier cas, la colonisation recente des zones temperees n'a entraine qu'une perte tres limitee de diversite au niveau des genes nucleaires. Nous avons montre que le cycle de vie des arbres forestiers, notamment leur longue phase juvenile, etait un element clef pour expliquer cela. Dans le second cas, nous avons au contraire montre que la forte variance et la correlation inter-generations dans le nombre d'enfants utiles (c'est a dire participant a la reproduction au sein de la population) amplifiaient fortement la derive. Ceci entraine une perte de diversite mais aussi, pour des variants rares, notamment des genes de maladie, la possibilite d'atteindre des frequences elevees. Le resultat general de ce travail est que les processus demographiques ont un impact important sur la diversite genetique des populations et qu'il est donc indispensable de les integrer pour comprendre celle-ci. Cela s'avere d'autant plus important que les donnees de genetique des populations sont de plus en plus utilisees pour estimer des parametres genetiques, tels que le taux de mutation ou de recombinaison.