Etude de la specificite d'interaction entre la nucleoline et le pre-arn ribosomique

Interaction specificity between nucleolin and pre-rrna

• Auteur / Autrice : GUILLAUME SERIN
• Direction : François Amalric
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Résumé

La nucleoline est une proteine abondante du nucleole, compartiment nucleaire devolu a la biogenese des ribosomes. Dans ce processus complexe, la nucleoline a ete fonctionnellement impliquee dans la maturation du pre-arn ribosomique. Par son abondance et ses proprietes de navette nucleo-cytoplasmique, elle peut aussi etre impliquee dans d'autres etapes necessaires a la formation du ribosome. La nucleoline possede a son extremite c-terminale quatre domaines de liaison a l'arn (rbd) et un domaine riche en arginine et glycine (rgg). Differents travaux menes sur d'autres proteines ont montre que les domaines rbd permettaient aux proteines d'interagir specifiquement avec certaines sequences d'arn. Les etudes menees au cours de ma these ont eu pour but de determiner les sites reconnus specifiquement par la nucleoline sur le pre-arnr et de definir le mecanisme de reconnaissance de ces sites. Les resultats obtenus montrent qu'il existe au moins deux types de motif arn qui permettent la fixation de la nucleoline au pre-arnr. Une premiere sequence cible (nre) est retrouvee tout le long du pre-arnr, a differentes positions (notamment aux extremites 5 et 3) conservees chez les mammiferes. Le role exact de l'interaction de la nucleoline avec ces sites reste encore inconnu. La deuxieme sequence cible (boite m3), conservee chez les vertebres, est impliquee dans une etape de maturation du pre-arnr, le clivage precoce. L'interaction de la nucleoline avec cette cible est requise pour ce clivage in vitro. La reconnaissance specifique de ces deux cibles arn par la nucleoline necessite la cooperation de differents domaines rbd. Les deux rbd n-terminaux de la nucleoline sont necessaires et suffisants a l'interaction avec l'arn nre tandis que la reconnaissance de la boite m3 necessite au moins un domaine rbd supplementaire. La nucleoline peut donc interagir avec au moins deux cibles arn differentes a l'aide de combinaisons differentes de rbd. Certains rbd sont impliques dans les deux types d'interaction. La nucleoline constitue donc un excellent systeme pour etudier les interactions arn-proteine, en particulier pour etudier la specificite d'interaction des domaines rbd avec l'arn.