Thèse soutenue

Cartographie de genes de fonction connue chez le colza. Exploitation de donnees acquises sur le genome modele arabidopsis thaliana

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Auteur / Autrice : MARIE FOURMANN
Direction : GEORGES PELLETIER
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
Date : Soutenance en 1998
Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

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L'objectif de cette etude etait de tester la possibilite de transferer rapidement et aisement par la technique de pcr des informations genomiques acquises sur l'espece modele arabidopsis thaliana vers l'espece cultivee brassica napus. Nous avons choisi la strategie gene candidat pour exploiter des sequences de genes de fonction susceptibles d'intervenir dans des caracteres agronomiques du colza ou localises a une position genetique candidate. Ces caracteres concernaient la qualite des graines de colza (teneur en acides gras et glucosinolates), la resistance ou tolerance a des pathogenes et la date de floraison. L'efficacite d'amorces pcr gene-specifique, consensus arabidopsis-colza a ete etudiee pour 36 locus. 98 genes de colza ont ete identifies, ainsi que 47 chez b. Oleracea et 50 chez b. Rapa, genomes ancestraux du colza. En comparant les quatre genotypes de colza utilises, 36 genes sont apparus polymorphes sur gel d'acrylamide non denaturant et ont ete positionnes sur la carte genetique developpee a l'inra de rennes. Le sequencage des fragments amplifies valide l'homologie entre arabidopsis et les brassica utilisees et revele chez le colza un polymorphisme supplementaire, utile pour developper des marqueurs moleculaires. Ces donnees permettent d'etablir la correspondance entre un gene de colza et un gene de b. Oleracea ou b. Rapa et d'attribuer une origine supposee aux groupes de liaisons de ce genome. Par l'approche gene candidat nous avons identifie les genes responsables du caractere faible teneur en acide erucique, exploite dans les varietes cultivees depuis plus de trente ans. Nos resultats devraient encourager le developpement de tels marqueurs moleculaires non seulement pour exploiter des informations geniques et genetiques obtenues sur arabidopsis, mais aussi pour fournir des marqueurs d'ancrage pour comparer les genomes de brassicacees. Enfin, cette approche peut aboutir a des marqueurs directs de qtls utilisables dans la selection du colza.