Cartographie integree et comparee du genome de la chevre. Application au clonage positionnel chez les ruminants : exemple du gene caprin d'intersexualite et d'absence de cornes (pis)

An integrated and comparative map of the goat genome. Application to positional cloning in ruminants : example of the goat polled-intersex syndrome (pis)

• Auteur / Autrice : Laurent Schibler
• Direction : Edmond-Paul Cribiu
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Les projets genomes humains et murins ont stimule le developpement de la cartographie genetique dans de nombreuses especes. Des cartes genetiques ont ete obtenues permettant de localiser des genes d'interet/qtl chez les principales especes d'elevage. Le maillage de ces cartes est cependant trop lache pour appliquer ces resultats dans des schemas de selection assistee par marqueurs ou pour entreprendre le clonage positionnel de ces genes. Des approches ciblees doivent etre developpees pour densifier regionalement des cartes. Une des strategies consiste a utiliser, par cartographie comparee, les informations disponibles chez l'homme et la souris. L'evolution des connaissances du genome caprin a ete plus lente et seuls 20 marqueurs microsatellites etaient isoles en 1995. C'est pourquoi une carte genetique et cytogenetique integree de la chevre a ete construite, incorporant des microsatellites et des genes/est. La carte genetique comporte 307 marqueurs, essentiellement bovins et ovins, dont 127 sont ainsi cartographies dans les trois especes de ruminants. Le developpement de la carte cytogenetique a repose sur la construction d'une banque de bac, organisee selon un schema 3d. La carte cytogenetique comporte 200 genes repartis sur l'ensemble du genome et 124 microsatellites. Compte tenu des localisations connues chez les bovins et ovins, 252 loci possedent une information de localisation, dont 247 sont egalement cartographies chez l'homme et 173 chez la souris, constituant une base solide de cartographie comparee. Cette carte, utilisable pour les ruminants, couvre pres de 90% du genome. Elle permet d'atteindre une resolution genetique de 10 cm et une resolution cytogenetique de deux bandes caprines et humaines. Ce travail a permis de preciser les regions d'homologie chromosomique entre les ruminants et l'homme, obtenue par coloriage heterologue, mettant en evidence l'existence de nombreux remaniements intrachromosomiques. Ces resultats permettront d'aborder rapidement la localisation fine et l'etude des genes/qtl caprins et ovins. En effet, la resolution obtenue permet d'envisager l'utilisation efficace de la carte comparee homme-ruminants afin d'enrichir en marqueur une region specifique du genome, comme en temoigne l'application de cette strategie a la recherche du gene motte (pis) caprin.