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Etude des bases genetiques de la resistance partielle du riz au virus de la panachure jaune (rymv). Cartographie moleculaire et relation avec la diversite genetique
| Auteur / Autrice : | Laurence Albar |
| Direction : | Alain Ghesquière |
| Type : | Thèse de doctorat |
| Discipline(s) : | Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie |
| Date : | Soutenance en 1998 |
| Etablissement(s) : | Paris 11 |
Résumé
La resistance partielle du riz (oryza sativa l. ) au virus de la panachure jaune (rymv) a ete etudiee a partir d'une collection de 130 varietes representatives de la diversite morphologique et genetique chez o. Sativa. Les symptomes et l'estimation du contenu en virus par test elisa indiquent une meilleure resistance des varietes japonica que des varietes indica et, au sein des varietes japonica, une meilleure resistance des varietes pluviales que des varietes temperees. Le contenu en virus, les symptomes et l'impact du rymv, au champ, sur des caracteres morphologiques ont ete etudies dans des populations de lignees haploides doublees, issues de croisements indica x japonica pluvial (ir64/azucena et irat177/apura). Nos resultats soulignent le caractere polygenique de la resistance partielle au rymv et montrent une relation entre la resistance et la morphologie. Des correlations phenotypiques ont ete detectees entre le niveau de resistance et le tallage, et en moindre mesure la hauteur. Des qtl de resistance ont ete cartographies par marquage moleculaire (rflp) sur huit regions du genome dont certaines sont egalement impliquees dans la morphologie. En particulier, le gene de semi-nanisme sd-1 est localise dans une region fortement impliquee dans la resistance. Sur le chromosome 12, un qtl de resistance a ete detecte dans les deux populations et semble independant de la morphologie. Dans la population ir64/azucena, ce qtl est implique dans des interactions avec d'autres regions du genome, notamment une region du chromosome 7. L'introgression du qtl du chromosome 12 dans la variete ir64 est en cours afin de valider son effet dans un fond genetique indica. Par ailleurs, la diversite genetique de la collection de varietes a ete etudiee a l'aide de marqueurs rflp cartographies au niveau de ce qtl : dans cette region, le polymorphisme est etroitement lie a la fois a la resistance au rymv et a la differenciation indica/japonica.