Une etude des modifications structurelles des polynucleotides suite a l'interaction avec des molecules exogenes d'interet biologique
Auteur / Autrice : | GAVIN WHEELER |
Direction : | LAURENT CHINSKY |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Sciences biologiques fondamentales et appliquées. Psychologie. Sciences médicales |
Date : | Soutenance en 1998 |
Etablissement(s) : | Paris 11 |
Résumé
Pendant cette these on a etudie les interactions entre des polynucleotides utilises comme des modeles de l'adn et quelques molecules utilises therapeutiquement dans le traitement des tumeurs et des virus tels que le vih, surtout les derives metalliques de tetrakis n-methyl-pyridyl-porphine (tmpy-p4), une groupe de molecules qui ont aussi un grand interet dans le biologie. Pour cette etude nous avons utilise principalement le spectroscopie raman de resonance, qui est tres sensible aux modifications structurelles du genre qu'on cherche a etudier, et qui nous permet de viser un chromophore donne dans un systeme, dans ce cas ou bien la structure des acides nucleiques ou bien celle de la molecule exogene utilisee. Ceci nous permet de nous pencher surtout sur les modifications induites dans la structure des acides nucleiques lors d'une interaction, ce qui complemente en quelque sorte les etudes precedentes sur les porphyrines, qui favorisent l'etude de la structure des porphyrines elles-memes. Nous avons egalement fait appel a quelques autres techniques, tels que le dichroisme circulaire, le sondage de structure par fluorescence de terbium, et la microcalorimetrie, qui apportent des informations complementaires a celles fournis par la spectroscopie raman. Les etudes precedentes avaient propose deux modes d'interaction pour ce groupe de porphyrines, l'intercalation dans les sites 5'-cg-3' et la liaison a l'exterieur sur les sites a#nt#n : un troisieme mode d'interaction, l'empilement de molecules de porphyrine a l'exterieur de l'helice, avait ete observe uniquement dans le cas du tmap, une autre porphyrine. Le metal incorpore au centre du cycle porphine de la molecule joue une role tres important dans la determination du mode d'interaction favorise. En effet, un metal six coordonne, avec des groupements ligandes qui se trouvent hors du plan de la molecule, empeche l'intercalation, qui est le mode prefere lorsqu'il y a un metal quatre coordonne au centre. Nos etudes nous ont permis de mettre en evidence l'existence de plusieurs modes d'interaction a l'exterieur de l'helice, et non pas une seule, ainsi qu'une particularite de l'intercalation de cu(tmpy-p4) avec poly(dgdc)#2 par rapport aux celles des autres derives 4-coordonnes. Nous avons utilise nos donnees pour proposer des geometries pour ces modes d'interaction.