Variabilite chloroplastique et mitochondriale chez les chenes blancs europeens a deux echelles spatiales

Chloroplast and mitochondrial variability in european white oaks at two spatial scales

• Auteur / Autrice : SYLVIE DUMOLIN LAPEGUE
• Direction : Antoine Kremer
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Notre travail a consiste en l'etude de la diversite des chenes blancs europeens a partir de marqueurs chloroplastiques et mitochondriaux, obtenus par pcr-rflp. Nous avons poursuivi la mise au point de ces paires d'amorces, universelles, permettant d'explorer une plus grande partie de ces genomes. Nous avons egalement utilise de nouvelles techniques pour detecter davantage de polymorphismes (sscp) et mieux les decrire (sequencage, amplification specifique d'alleles et pcr emboitee). Nous avons ainsi pu etudier la differenciation genetique ainsi que la variabilite geographique et phylogeographique au niveau europeen, et au niveau plus fin de la region sud de la france. Les resultats confirment une forte differenciation et une tres forte structuration geographique doublee d'une structuration phylogeographique. Une quatrieme zone refuge a ete envisagee dans le caucase pour expliquer la repartition des types cytoplasmiques a l'est de l'europe. De plus, les echanges cytoplasmiques importants entre especes ont ete confirmes mais des differences entre couples d'especes ont ete mises en evidence. D'autre part, il semble que la composition specifique des populations ainsi que la physionomie forestiere doivent etre pris en compte dans l'etude de la diversite genetique. Nous avons egalement demontre la transmission maternelle de ces genomes cytoplasmiques a partir de croisements controles intraspecifiques. Nous nous sommes interesses a l'importance d'evenements rares de contamination paternels susceptibles de remettre en cause une evolution clonale de ces genomes. Deux approches, phylogenetique et populationnelle, ont ete realisees qui n'ont pas permis d'apporter des arguments en faveur de tels evenements. Enfin, nous avons reussi a amplifier de l'adn degrade de bois ancien, ouvrant la porte a de nouvelles perspectives fondamentales et appliquees.