Analyse fonctionnelle de genes decouverts par le sequencage genomique systematique de la levure s. Cerevisiae

• Auteur / Autrice : ANETA KANIAK
• Direction : PIOTR SLONIMSKI
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Pour elucider le role physiologique des genes de fonctions inconnues, reveles dans la sequence complete du genome de la levure s. Cerevisiae, notre laboratoire a realise les projets d'analyse fonctionnelle de genes des chromosomes iii et ix. Nous avons construit au laboratoire une collection de mutants en inactivant, un par un, environ 100 nouveaux genes repartis sur les deux chromosomes. Une partie de ma participation au projet s'agissait d'inactiver plusieurs genes du chromosome iii : ycr071c, ycr072c, ycr073c et ycr073w-a (ycr074bw). J'ai trouve que la fonction de ycr072c est essentielle pour la viabilite de la cellule. Cependant, nous avons concentre nos efforts sur les genes majoritaires dont les deletions sont viables et souvent n'ont pas phenotype identifiable dans les conditions habituelles au laboratoire. Nous nous sommes propose d'aborder les fonctions de ces nouveaux genes par deux methodologies complementaires : (1) approche horizontale et (2) approfondissement vertical. Dans le premier cas, j'ai pris part au developpement d'une serie de tests (plus de 100) pour la recherche de phenotypes des mutants. Ces tests font surtout appel a diverses conditions de stress (temperature, osmolarite, ph extremes, stress oxydatif) et inhibiteurs specifiques de differents processus physiologiques. Dans les etudes plus approfondies, j'ai etudie principalement : (1) le gene ycr071c/img2 et (2) une paire de genes homologues, yil153w/rrd1 et ypl152wrrd2. Nous avons montre que le produit du gene ycr071c/img2 est essentiel pour la respiration et l'integrite du genome mitochondrial. Nos donnees suggerent que les proteines, img2p de levure et nof1 humaine (qui ressemble a un certain degre a img2p) ont une fonction conservee dans les mitochondries des cellules eukaryotes et qui pourraient intervenir dans le fonctionnement de l'appareil de la traduction mitochondriale. Quant aux deux genes yil153w/rrd1 et ypl152w/rrd2, les proteines predites pour ces genes sont homologues des proteines de mammiferes qui ont ete caracterisees in vitro, mais dont la fonction in vivo est inconnue. Nos resultats sont compatibles avec un role des rrdp comme regulateurs positifs de l'activite de la phosphatase pp2a contrebalancant des phosphorylations catalysees par des kinases dans les diverses voies de traductions de signal.