Modelisation de la progression des marqueurs biologiques de l'infection a vih : approches biostatistique et biomathematique

• Auteur / Autrice : EMMANUELLE LE CORFEC
• Direction : Dominique Costagliola
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences médicales
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Les progres accomplis dans le domaine de la pathogenese de l'infection a vih sont tres lies aux avancees dans le domaine des techniques de mesure de marqueurs viraux et immunologiques. La possibilite de collecter ces mesures, en particulier nombre de lymphocytes t cd4+ et mesures d'arn vih-1 plasmatique, a suscite le developpement de methodes statistiques d'analyse de donnees longitudinales pour etudier la progression des marqueurs, et la mise au point de modeles mathematiques d'interaction entre le vih et le systeme immunitaire afin d'avancer dans la comprehension des mecanismes mis en jeu ou de quantifier la cinetique du virus. Notre travail s'inscrit dans cette double approche. La premiere partie est une approche statistique visant a quantifier l'impact de donnees manquantes dues a un suivi interrompu sur le resultat de l'analyse d'un essai, dans le cadre des essais cliniques vih ou le critere principal est une mesure resumee de la charge virale plasmatique. Nous avons montre que, du point de vue de la taille du test, les meilleures methodes d'analyse sont un modele a effets mixtes incluant un changement de pente apres 2 semaines de traitement, et dans une moindre mesure, l'aire sous la courbe en reportant la derniere mesure connue. La deuxieme partie est une approche biomathematique : nous avons developpe un modele stochastique de la primo-infection du vih, afin de predire la dynamique du virus aux stades precoces de l'infection, ou peu de donnees sont disponibles sur la progression des marqueurs. La variabilite liee aux mecanismes d'infection des lymphocytes t cd4+ est modelisee par un processus de diffusion. Le modele a permis de predire la distribution du temps entre l'infection et la detection possible du virus dans le plasma de patients infectes, par des techniques de quantification de l'arn vih-1 par amplification des acides nucleiques (naa). Une application est l'evaluation du benefice de l'utilisation potentielle de tests naa dans le cadre des dons de sang : en france, le benefice maximal attendu par rapport au test des anticorps serait inferieur a trois dons infectes par an. L'utilisation d'un modele stochastique est particulierement importante dans des situations ou le virus est en faible concentration, et devra etre envisagee egalement pour l'etude de la dynamique du virus sous traitement antiretroviral a long terme.