Prediction d'epitopes et production d'anticorps monoclonaux anti-atpase (h +,k +) gastrique et anti-cftr
Auteur / Autrice : | MUSTAPHA IRNATEN |
Direction : | Annick Thomas-Soumarmon |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Sciences biologiques fondamentales et appliquées |
Date : | Soutenance en 1998 |
Etablissement(s) : | Paris 5 |
Résumé
Nos travaux actuels se focalisent sur les relations structure-fonction de l'atpase (h +,k +) et de la cftr (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator). Ce sont deux hydrolases de l'atp qui transportent des ions. Elles sont transmembranaires, impliquees dans le transport des ions, h + et k + pour l'atpase (h +,k +), et cl pour la cftr. Le travail que j'ai entrepris consiste a mettre en evidence, l'atpase (h +,k +) dans la muqueuse gastrique et le canal de type cftr. Ceci par le biais de la production, par immunisation, d'anticorps monoclonaux, dont les epitopes sont predits par modelisation moleculaire. L'atpase (h +,k +), situee au pole apicale de la cellule parietale, est une proteine responsable de la secretion acide gastrique. Elle est formee de 4 segments transmembranaires en amont d'une large boucle catalytique intracytoplasmique (40% de la proteine), et de 4 a 6 segments, constituant la partie c-terminale, en avale de celle-ci. Pour realiser son cycle catalytique, l'atpase hydrolyse l'atp, se phosphoryle puis se dephosphoryle. Elle se trouve alors sous forme de deux etats conformationnels e1-f2. La cftr est un canal qui laisse passer les ions cl des cellules epitheliales vers les milieux extracellulaires luminaux. L'atp regule la permeabilite et plus precisement accroit la probabilite d'ouverture du canal sans activer le transport qui reste passif. L'analyse par homologie de sequences, permet de classer cftr dans la famille des proteines atp binding cassette (abc) ou trafic atpases. Cftr est formee de 12 domaines transmembranaires hydrophobes. La partie cytoplasmique est constituee de deux domaines hydrophiles liant les nucleotides nbd1 et nbd2 pour nucleotide binding domaine et d'un domaine regulateur r domain), riche en sites potentiels de phosphorylation.