La regulation post-transcriptionnelle du gene rpos codant pour la sous-unite sigma s de l'arn polymerase d'escherichia coli

The post-transcriptional regulation of the rpos gene encoding for the sigma s subunit of rna polymerase in escherichia coli

• Auteur / Autrice : SANDRINE BOUCHE
• Direction : Yanick Auffray
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1998
• Etablissement(s) : Caen

Résumé

Le gene rpos code pour la sous-unite sigma s de l'arn polymerase d'escherichia coli et il est implique dans l'induction en phase stationnaire et en reponse a divers stress d'un ensemble de genes. L'expression de rpos est regulee au niveau de la transcription, de la traduction et de la stabilite de la proteine. Dans notre etude, nous nous sommes interesses a la regulation post-transcriptionnelle de rpos. Nous avons propose que l'arnm de rpos, autour de la region d'initiation de la traduction (sd), se repliait pour former une structure secondaire. Des mutations qui modifient la stabilite energetique de la structure contenant le site de fixation des ribosomes peuvent modifier l'expression de rpos (comme cela fut montre avec la fusion de proteines rpos379 :: lacz). Nous avons conclu que la structure secondaire de l'arnm de rpos jouait un role dans la regulation traductionnelle de sigma s. La proteine rssb, regulateur de reponse potentiel d'un systeme a deux composants, est essentielle pour la degradation rapide de sigma s dans des cellules non stressees en croissance. Jusqu'a ce jour, aucune histidine kinase ou phosphatase correspondante n'a pu etre identifie. L'acetyl-phosphate est un donneur alternatif de groupement phosphate pour des regulateurs de reponse mais dans la plupart des systemes testes jusqu'a present, il ne semble pas jouer un role physiologique preponderant. Nous avons pu demontrer que des mutants pta acka, incapables de synthetiser de l'acetyl-phosphate, presentaient un niveau plus important de sigma s et de proteine hybride rpos742 :: lacz et que cet effet dependait de la presence de la proteine rssb. Nous proposons que le niveau d'acetyl-phosphate, variable en fonction du milieu du culture, possede un role de modulateur dans la regulation de la degradation de sigma s et que l'acetyl-phosphate agit en modifiant la phosphorylation et par consequent l'activite du regulateur de reponse, rssb.