Thèse soutenue

Contribution à l'établissement de la carte génomique comparée entre l'homme et le porc (Sus scrofa domestica), par "coloriage chromosomique"

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Auteur / Autrice : André Goureau
Direction : Martine Yerle-Bouissou
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie et génétique moléculaires et cellulaire. Biotechnologie
Date : Soutenance en 1997
Etablissement(s) : Toulouse 3 en cotutelle avec Toulouse 3

Résumé

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La conservation de groupes de genes entre especes se traduit par une correspondance entre segments chromosomiques des differentes especes. Il est donc possible de faire de la cartographie comparee et de presumer la localisation d'un gene dans une espece en fonction de celle qu'il occupe dans une autre espece, et, par consequent, de mettre a profit une carte bien developpee (homme, souris) pour faire progresser celles qui sont moisn avancees (porc). L'objectif de ce travail etait donc de determiner aussi completement que possible les correspondances entre chromosomes porcins et chromosomes humains. Pour obtenir efficacement un tel resultat nous avons utilise la technique du coloriage chromosomique en conditions heterologues. Pour disposer de correspondances segment a segment nous avons procede dans les deux sens, c'est-a-dire que nous avons hybride les sondes chromosomiques humaines sur les chromosomes porcins et hybride en retour les sondes chromosomiques porcines sur les chromosomes humains. Les sondes chromosomiques des 22 autosomes humains ont ete hybridees et ont marque 95% du lot haploide d'autosomes procins. En retour, deux sondes chromosomiques porcines n'etant pas disponibles et trois autres n'ayant pas donne de resultat, seulement 65% du lot haploide d'autosomes humains ont ete marques par les sondes chromosomiques de 13 autosomes porcins. Nous avons dresse la carte des segments conservees entre l'homme et le porc pour la quasi totalite des deux genomes. Il y a une tres bonne correlation entre les donnees de cartographie comparee et les determinees par coloriage chromosomique. Les quelques cas de discordance sont discutes. De nouvelles correspondances ont ete mises en evidence. Les resultats obtenus par ailleurs par hybridation de sondes chromosomiques humaines sur chromosomes bovins d'une part, et par hybridation de sonde chromosomiques porcines sur chromosomes bovins d'autre part, ont ete pris en compte, ce qui nous a permis dhetablir une carte preliminaire des syntenies conservees entre les trois especes. Nous avons enfin procede a une comparaison de ces resultats avec la carte comparee homme-souris et l'existence de syntenies ou de segments tres conserves chez les mammiferes, autres que celle liee au chromosome x, est avancee