Analyse d'une famille multigénique de la région hla de classe i

Analysis of a multigene family within the hla class i region

• Auteur / Autrice : Gwenaëlle Carn
• Direction : Jean-Yves Le Gall
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques
• Date : Soutenance en 1997
• Etablissement(s) : Université de Rennes 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Maladies héréditaires métaboliques

Résumé

Ce travail s'est inscrit au depart dans le cadre d'une strategie de clonage positionnel visant a identifier le gene dont l'anomalie est responsable de l'hemochromatose. L'hemochromatose est la maladie hereditaire a transmission autosomique recessive la plus frequente dans les populations d'origine caucasoide. Elle se caracterise par une surcharge progressive en fer de l'organisme, generatrice de graves lesions tissulaires. L'anomalie biochimique a l'origine de l'accumulation du fer reste inconnue. Le gene de l'hemochromatose a ete, dans un premier temps, localise sur le bras court du chromosome 6, en 6p21. 3, a moins d'un centimorgan du gene hla-a. Par la suite, des etudes de desequilibre de liaison entre le gene et des marqueurs de type rflp, ont amene a localiser le gene dans une region de 400 kilobases centree sur le locus hla-a. Sur la base de ces resultats, le laboratoire avait entrepris d'identifier de nouveaux genes dans cette region, par une technique de selection d'adnc. Sept nouveaux genes appeles hcg (pour hemochromatosis candidate gene) et numerotes de i a vii, ont ete isoles. Notre travail a porte sur l'etude de l'un des transcrits isoles, correspondant au gene hcg iv qui s'est revele appartenir a une famille multigenique. Au cours de nos tentatives pour reconstituer un adnc complet, quatre familles de transcrits ont ete identifiees. La localisation physique des differents loci de cette famille n'a pu etre definitivement etablie que grace a l'etablissement d'un ensemble de cosmides chevauchants issus d'une banque specifique du chromosome 6. Dix sequences genomiques ont ainsi ete identifiees et localisees a proximite des genes et pseudogenes hla de classe i de la region hla-a. Afin de determiner la structure complete de la region hla-j/hla-f et identifier l'ensemble des genes, une strategie de sequencage systematique a ete developpee. Nous avons sequence un cosmide de 42 kb contenant les sequences hcg iv. 3 et hcg iv. 4 ainsi que la sequence hcg iv. 5 a laquelle correspond l'une des familles de transcrits. Les structures genomiques des autres sequences hcg iv ont ete determinees par le sequencage d'autres cosmides. Il s'est avere que l'ensemble de ces sequences hcg iv presentait une organisation en genes chevauchants avec des sequences hla de classe i de la region hla-a