Etude de la variabilite genetique de fusarium oxysporum f. Sp. Vasinfectum, champignon pathogene du cotonnier

Genetic variability analysis of the cotton wilt fungus fusarium oxysporum f. Sp. Vasinfectum

• Auteur / Autrice : MARIE-PIERRE DUBOIS
• Direction : Didier Geiger
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1997
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Une etude de la diversite genetique de fusarium oxysporum f. Sp. Vasinfectum (fov), champignon responsable de la fusariose du cotonnier a ete realisee. La mise au point de marqueurs moleculaires rapd et rflp, et l'utilisation de l'electrophorese en champs pulses, a permis d'analyser la variabilite genomique de pupulations de fov. A une echelle macrogeographique, l'analyse d'une collection de 52 souches de fov provenant de diverses regions de culture du cotonnier dans le monde a montre que les populations de fov sont structurees en au moins 4 lignees clonales a large distribution geographique. La lignee 3 rassemble les isolats de la race 3, distribues uniquement en egypte, en israel et au soudan. Les isolats appartenant a la lignee 4 proviennent d'asie et rassemblent les isolats de la race 4. Les isolats appartenant aux lignees a1 et a2 sont presents en afrique et en amerique, et appartiennent a la race a. De plus, une importante variabilite chromosomique au sein de la forme speciale vasinfectum, suggerant une grande plasticite du genome de fov, a ete mise en evidence suite a l'etablissement de caryotypes electrophoretiques des souches et a l'analyse de la distribution d'elements transposables (fot 1, fot 2, impala, foret 1). A une echelle microgeographique (le soudan), une tres forte homogeneite genetique des souches a ete mise en evidence montrant clairement que cette population est clonale et forme une seule lignee genetique. De plus, il a ete montre par des tests de pouvoir pathogene, que seule la race 3 etait presente dans ce pays. La souche r5 decrite comme nouvelle race ne serait qu'un variant moins agressif de la race 3.