Thèse soutenue

Fonctionnalites d'un sgbd structural 2d/3d oriente vers la conception assistee : le prototype chemdarc

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Auteur / Autrice : Belhadri Messabih
Direction : Annick Panaye
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Chimie
Date : Soutenance en 1997
Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

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Dans cette these, apres une analyse critique des grands sgbd structuraux en ligne, nous proposons par extension du systeme darc des representations originales basees sur les frels et les cycles et leurs ecrans generiques. A cause de leur preponderance, ces derniers ont fait l'objet dans cette these d'une attention particuliere. Un algorithme original d'identification de l'union des bases des cycles minimaux est propose. Le prototype chemdarc developpe a partir de ces representations associe de facon cooperative les techniques de modelisation pseudo-moleculaire et de topologie structurale pour produire des bases de representations 2d/3d orientes vers la cao moleculaire. Chemdarc a ete concu pour etre facilement portable, autrement dit il utilise le systeme de fenetrage x-window qui connait un essor exceptionnel encore amplifie par le succes des interfaces graphiques osf/motif. Le langage graphique est a la norme phigs, un outil puissant dedie a la modelisation d'objets graphiques. Les efforts sur la comprehension des aspects fondamentaux des modeles topologiques et la recherche de nouveaux outils permettent de cerner la complexite de nombreux langages structuraux et degager certains caracteres generiques des structures moleculaires. Une des representations adoptees repose sur l'utilisation d'une hierarchie de classes basee sur les concepts de markush darc. Le prototype chemdarc (100 000 structures 2d et 70 000 structures 3d) est dote d'une interface graphique tres conviviale.