Organisation de la diversite genetique et histoire postglaciaire des chenes blancs europeens : approche experimentale et par simulation

Organisation of genetic diversity and post-glacial history of european white oaks : experimental approach and simulation studies

• Auteur / Autrice : Valérie Le Corre
• Direction : Antoine Kremer
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1997
• Etablissement(s) : Paris, Institut national d'agronomie de Paris Grignon

Résumé

Les chenes blancs europeens sont representes principalement par les chenes pedoncule (quercus robur l. ) et sessile (quercus petraea matt liebl. , presents dans l'ensemble de l'europe. Il s'agit d'arbres forestiers a generation longue, dont la variabilite genetique serait liee a la taille et le nombre des refuges lors de la derniere glaciation, ainsi qu'aux voies de recolonisation. L'etude de la diversite genetique des chenes blancs presente un interet fondamental, et pratique, pour la gestion des ressources genetiques. La partie experimentale de la these a porte sur un ensemble de population de chene sessile, echantillonnees sur l'aire de repartition. Leur diversite genetique a ete etudiee a l'aide de marqueurs biochimiques (allozymes) et moleculaire (rapd, random amplified polymorphic dna). Les chenes se caracterisent par une diversite genetique tres elevee, associee a une tres faible differenciation entre populations. Des analyses geostatistiques ont permis de decrire l'organisation geographique de la diversite et de la mettre en relation avec l'histoire postglaciaire. La comparaison de la diversite genetique nucleaire avec la diversite du genome chloroplastique, transmis par les graines, a permis d'evaluer l'importance des flux de pollen. Des modeles analytiques ont ete construits pour etudier les effets d'un processus de colonisation sur la diversite et la differenciation genetique. Ils mettent en evidence l'importance de l'origine et du nombre des colonisateurs, et de l'homogeneisation par les flux de genes. Des simulations ont permis de reconstituer de facon plus realiste la recolonisation postglaciaire. Une progression en front associee a des dispersions rares a longue distance permet, une colonisation rapide, et expliquerait la structuration geographique du genome chloroplastique a une echelle regionale. A l'echelle de l'aire de repartition, les simulations mettent en evidence des facteurs de la differenciation geographique : la derive genetique due aux evenements de fondation successifs, la rencontre d'obstacles geographiques, et le contact entre des mouvements de migration a partir de refuges differents. Ces resultats suggerent que les peuplements de chenes blancs ne sont pas a l'equilibre, et pourront aider a definir une politique de gestion des ressources genetiques.