Recherche Avancée

Thèse soutenue

Caractérisation moléculaire d'une t(1;22)(q21;q11) impliquée dans la progression tumorale dans les lymphomes malins non Hodgkiniens

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Auteur / Autrice : Mary Callanan
Direction : Dominique Leroux
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Biologie
Date : Soutenance en 1997
Etablissement(s) : Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015)

Résumé

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Les rearrangements du bras long du chromosome 1 sont parmi les plus frequemment observes dans les tumeurs humaines. La plupart de ces rearrangements impliquent la bande chromosomique 1q21. Ce sont soit des translocations desequilibrees soit moins frequemment des translocations equilibrees avec de nombreux chromosomes partenaires. Ces anomalies surviennent plutot au cours de l'evolution d'une tumeur et seraient donc impliquees dans la progression tumorale. Cependant elles ont aussi ete observees dans des etats preneoplasiques precedant de plusieurs mois, voire annees, l'eclosion de la tumeur maligne. Malgre leur frequence elevee et leur role potentiel dans les processus de tumorogenese, on ne connait ni les genes cibles de ces rearrangements en 1q21, ni les sites de cassure preferentiels. A ce titre, l'objectif de ce travail etait de cloner et caracteriser les points de cassure d'une translocation t(1;22) observee dans une lignee tumorale (b593) etablie a partir d'un lymphome de haut grade de malignite. Cette translocation implique sur le chromosome 1 la bande 1q21, point chaud de cassures dans les lymphomes, et sur le chromosome 22 la bande 22q11, locus des genes d'immunoglobulines lambda. Le fragment de jonction de cette translocation a ete clone, cartographie en detail et differents clones appartenant a la bande 1q21 isoles. La recherche systematique de sequences transcrites dans une region de 16,5kb entourant la jonction n'a revele la presence d'aucune unite transcriptionnelle fonctionnelle. Cependant un pseudogene original de la proteine ribosomique l31 a ete identifie a 6kb de la jonction et la lignee b593 montre un taux eleve d'arnm l31. Ce pseudogene presente les caracteres habituels des retroposons, il est flanque par des repetitions directes, ne comporte pas d'introns et porte une queue poly a. Il est cependant particulier du fait de la presence en 5' d'une sequence polypyrimidique terminale (5' terminal oligopyrimidine tract - 5' top), site d'initiation transcriptionnelle caracteristique des genes codant pour des proteines ribosomiques. Cette sequence est precedee d'une boite type tata, alors que les promoteurs de genes codant pour les proteines ribosomiques en sont depourvus. La signification de ces resultats dans le contexte d'une expression elevee de l31 est discutee. Afin de preciser la localisation du point de la cassure 1q21 observee dans la lignee b593, nous l'avons positionne par fish sur la carte physique/genetique integree du consortium du ceph, a l'aide de yacs de cette region. Cette approche a permis de localiser le point de cassure dans un grand intervalle de 8cm borne par les yacs 910c8 en position proximale et 907a11 en position distale, une region jusqu'alors non impliquee dans des cancers. Des yacs specifiques de la jonction ont ensuite ete isoles par criblage de la banque de yacs du ceph avec des amorces specifiques du point de cassure, permettant l'identification du yac 851a10 chevauchant le point de cassure 1q21 de la lignee b593. Le point de cassure d'une autre t(1;22) observee chez un deuxieme malade a egalement ete localise dans ce yac. Ce resultat suggere l'existence d'au moins un site oncogenique dans la region de 1q21 homologue au yac 851a10.