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des thèses françaises
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Cartographie physique et recherche de nouveaux gènes dand les règions chromosomiques 13Q12 et 8P11-P21
| Auteur / Autrice : | Alexandra Imbert |
| Direction : | Marie-Josèphe Pébusque |
| Type : | Thèse de doctorat |
| Discipline(s) : | Immunologie |
| Date : | Soutenance en 1997 |
| Etablissement(s) : | Aix-Marseille 2 |
| Partenaire(s) de recherche : | Autre partenaire : Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (1969-2011) |
Résumé
Nos travaux concernent l'etude des regions chromosomiques 13q12, par un modele d'evolution des recepteurs tyrosine kinase (rtk), et 8p11-p21, par une approche de clonage positionnel. Les genes flt1 et flt3, codant pour des rtk de classe v et iii respectivement, sont lies dans la region 13q12. Des regroupements de genes comprenant deux genes codant pour un rtk de classe iii et un gene codant pour un rtk de classe v sont localises sur les chromosomes 4q12 et 5q31-35. De plus, leur structure exon/intron est conservee. Ces observations suggerent une origine commune des rtk de classe iii et v. Un modele evolutif par cis et trans duplication, ainsi que par recrutement d'exons a ete propose. Celui-ci permet d'avancer l'hypothese de la presence d'un troisieme gene, codant pour un rtk de classe iii dans la region 13q12. Nous avons etabli une cartographie physique de cette region. Les genes flt1 et flt3 sont separes par environ 150kb dans une configuration tete queue. Trois ilots cpg sont presents dans la region, l'un d'entre eux pourrait etre annonciateur d'un gene putatif codant pour un rtk de classe iii. La region p11-21 du bras court du chromosome 8 est impliquee dans de nombreuses pathologies, incluant des tumeurs malignes pour lesquelles des deletions, des amplifications, ou encore des translocations ont ete decrites. Dans le cancer du sein sporadique, deux types d'alterations sont frequemment observees: amplification d'un oncogene (8p12), et/ou deletion d'un ou plusieurs genes suppresseurs de tumeur (8p11-p21). De plus, des analyses de liaison ont suggere la presence d'un troisieme gene de susceptibilite au cancer du sein familial, brca3, sur le chromosome 8p. Une carte physique et genetique de la region a ete etablie dans la region d'interet. Plusieurs techniques de clonage de genes sont utilisees en vue d'etablir une carte transcriptionnelle detaillee. Nous pourrons ainsi identifier les genes candidats impliques dans la cancerogenese mammaire