Analyse structurale et fonctionnelle de cis-éléments des promoteurs des gènes EF-1alpha d'Arabidopsis thaliana
Auteur / Autrice : | Farid Regad |
Direction : | Bernard Lescure |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Biologie moléculaire et cellulaire végétale |
Date : | Soutenance en 1996 |
Etablissement(s) : | Toulouse 3 |
Mots clés
Mots clés contrôlés
Mots clés libres
Résumé
Le gene codant pour le facteur d'elongation de la traduction ef-1alpha a1 chez arabidopsis thaliana a ete utilise comme systeme modele pour etudier les mecanismes de regulation de mise en place coordonnee des elements de la machinerie de traduction chez les angiospermes. Le role de deux cis-elements de ce promoteur, boite tef et boite telo, font l'objet de cette these. Des sequences homologues a la boite tef sont observees dans plusieurs promoteurs de genes codant pour des elements de la machinerie de traduction ou impliques dans le controle de l'etat redox de la cellule. La plupart de ces genes sont specifiquement exprimes ou sur-exprimes en reprise de croissance ou dans les tissus meristematiques. In vitro et in vivo nous avons montre que l'element tef est un cis-element ubiquitaire chez les angiospermes participant a l'activation transcriptionnelle lors de la reprise des divisions cellulaires. La sequence consensus de cet element est arggry annnnngtaa. L'importance de ce mecanisme de regulation nous a conduit a envisager la caracterisation des genes codant pour les proteines interagissant avec l'element tef. Nous rapportons ici les donnees preliminaires concernant la purification de ces proteines. La boite telo, element homologue a 1,5 unite de repetition des telomeres de plantes, est frequemment associee a l'element tef dans divers promoteurs. La deletion de cet element n'affecte pas l'expression. Toutefois nous montrons que des proteines nucleaires reconnaissent specifiquement ce motif. Par ailleurs une analyse statistique revele que la boite telo est sur-representee dans le genome d'arabidopsis et est preferentiellement localisee dans les regions 5' des genes. Cette localisation a ete confirmee par l'isolement et l'analyse de clones de cdna contenant des sequences telo. Nous proposons un modele permettant d'expliquer la sur-representation et la localisation de ces motifs a l'interieur du genome