Caractérisation du gène ndd du bactériophage T4. Etude de l'effet de la protéine NDD sur le nucléoi͏̈de bactérien

Characterization of the bacteriophage t4 ndd gene effects of the ndd proteins on the bacterial nucleoid

• Auteur / Autrice : Jean-Yves Bouet
• Direction : Jean-Michel Louarn
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Microbiologie
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Toulouse 3

Mots clés

Mots clés contrôlés

Chromosome bactérien

Interactions ADN-protéine

Bactériophage T4

Bactériophage T4

Résumé

Chez la bacterie escherichia coli, l'adn genomique est constitue d'une molecule circulaire de 4,6 10#6 paires de bases. Cette molecule d'adn doit etre organise pour permettre a la fois sa condensation dans la cellule et les activites transcriptionnelles et replicatives continuelles caracteristiques des procaryotes. Cependant l'organisation generale des chromosomes bacteriens est encore largement enigmatique. Les travaux presentes dans ce memoire s'inscrivent dans le cadre de l'analyse a grande echelle du nucleoide bacterien. Nous nous sommes interesse a l'etude d'un phenomene physiologique induit par le bacteriophage t4, la disruption nucleaire. En effet, en quelques minutes, le produit du gene phagique ndd est capable de detruire completement l'organisation du nucleoide. La proteine ndd pourrait donc etre un moyen d'investigation de la structure et de l'organisation du chromosome bacterien. L'introduction generale presente les donnees acquises concernant la structure et l'organisation du chromosome bacterien. Les principaux resultats obtenus au cours de ce travail sont publies. Le premier article (gene, 1994) concerne l'identification du gene ndd et sa conservation importante parmi l'ensemble de la famille des bacteriophages t-pairs. Le second article (mol. Microbiol. , 1996) presente les effets physiologiques de l'expression du gene ndd clone. Les resultats obtenus ont permis de montrer que la proteine ndd est, a elle seule, capable de provoquer le phenomene de disruption nucleaire. Cette desorganisation complete du nucleoide, accompagnee d'une importante letalite des cellules, est realise sans la moindre destruction de l'adn chromosomique. L'ensemble des resultats est consistant avec une alteration specifique d'elements structuraux du nucleoide provoquee par la proteine ndd. D'autre part, l'etude de la proteine ndd thermosensible a permis de montrer qu'elle possede, in vitro, une activite de liaison a l'adn double brin. Les donnees presentees dans ce memoire sont discutees dans le dernier chapitre. Elles confirment amplement notre hypothese d'utiliser ndd comme moyen d'investigation de la structure du chromosome bacterien