Recherche de marqueurs rapd lies a deux resistances aux virus chez la tomate
Auteur / Autrice : | VERONIQUE CHAGUE |
Direction : | A. CHAUDRON DE COURCEL |
Type : | Thèse de doctorat |
Discipline(s) : | Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie |
Date : | Soutenance en 1996 |
Etablissement(s) : | Paris 11 |
Résumé
La bulked segregant analysis (bsa) a ete utilisee pour identifier des marqueurs rapd (random amplified polymorphic dna) lies a deux resistances aux virus chez la tomate. La premiere concerne la resistance au tomato spotted wilt virus (tswv) conferee par le gene dominant sw-5. L'utilisation de deux pools formes a partir d'une population f2 segregeant pour la resistance a permis l'identification de quatre marqueurs rapd lies au gene sw-5. Tous ces marqueurs sont localises sur un meme groupe de liaison couvrant 10,5 cm, et on ete cartographies au niveau du chromosome 9 sur la carte rflp developpee par tanksley et coll. (1992). Deux d'entre eux, dont l'un a ete transforme en scar, apparaissent etroitement lies au gene. Par ailleurs, un autre des marqueurs trouves, lie en phase repulsive, a permis l'identification des individus heterozygotes et des individus sensibles. La specificite de ce dernier a ete optimisee en le transformant en pseudo-scar. Enfin, l'analyse de populations f3 et bc2 a confirme leur liaison a la resistance au tswv. Ces differents marqueurs sont maintenant utilises en selection assistee. La seconde resistance etudiee est a determinisme oligogenique, et concerne le tomato yellow leaf curl virus (tylcv). Deux pools ont ete formes a partir d'individus de lignees recombinantes f4 presentant les phenotypes de resistance et de sensibilite les plus extremes. Le criblage de ces pools par 600 decameres aleatoires a permis de detecter un qtl, identifie par quatre marqueurs rapd, expliquant environ 20% de la resistance. Ces marqueurs couvrent une region de 17,3 cm, et ont ete integres au niveau du chromosome 6 sur la carte rflp developpee par tanksley et coll. (1992)