Etude biochimique et moleculaire de nouvelles souches d'agrobacterium tumefaciens

Biochemical and molecular analysis of new agrobacterium tumefaciens isolates

• Auteur / Autrice : VALERIE VAUDEQUIN-DRANSART
• Direction : Yves Dessaux
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1996
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Des souches pathogenes d'agrobacterium, isolees de tumeurs sur ficus benjamina (souches fig) et sur chrysantheme (souches chry), induisent des galles qui contiennent, en plus de la nopaline ou de la leucinopine et de la succinamopine, trois nouveaux composes de type opinique. Ces molecules sont la deoxyfructosyl oxoproline (dfop), la deoxyfructosyl glutamine (dfg) et sa lactone, la chrysopine. Elles ressemblent respectivement aux mannityl opines, acide agropinique, mannopine et agropine. Deux nouvelles classes de plasmides ti sont ainsi definies: a chrysopine-succinamopine et a chrysopine-nopaline. Les souches chry catabolisent toutes les opines dont elles induisent la synthese. La region catabolique de la chrysopine et de la dfop a ete localisee sur le plasmide ti de la souche ant4. Son organisation ressemble a celle de la region catabolique des mannityl opines sur le pti15955. La degradation de la chrysopine met en jeu une dfg-cyclase, comme celle de l'agropine implique une mannopine-cyclase. Les genes determinant ces activites semblent peu homologues. La dfg ne presente pas l'etroite specificite induction/degradation rencontree chez toutes les souches d'agrobacterium tumefaciens. Elle est degradee par un grand nombre de souches d'agrobacterium, meme non pathogenes, qui toutes contiennent un megaplasmide cryptique. C'est la premiere fois qu'une fonction peut etre attribuee au plasmide cryptique des agrobacterium. La dfg pourrait, par ses caracteristiques biochimiques, etre l'opine ancestrale dont l'existence a ete postulee dans de precedents travaux. Dans le cas de la souche ant4, le megaplasmide conferant l'utilisation de dfg et le pti sont capables de se cointegrer lors de transferts conjugatifs, sans qu'il existe de site preferentiel pour cette cointegration. La resolution des cointegrats peut affecter certaines fonctions plasmidiques. Les souches fig presentent de nombreuses particularites. Elles ne degradent ni la dfg, ni la dfop. Leurs pti montrent tres peu d'homologies avec les pti de souches d'agrobacterium tumefaciens de reference. Ces isolats pourraient constituer une nouvelle espece d'agrobacterium