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Thèse soutenue

Caractérisation du transposon catabolique tn4371 d'alcaligènes eutrophus a5

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Auteur / Autrice : Christophe Merlin
Direction : Ariane Toussaint
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences biologiques
Date : Soutenance en 1996
Etablissement(s) : Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015)

Résumé

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Le phenotype catabolique associe a tn4371 est gouverne par une batterie de genes groupes sur une region de 13 kpb, dans la partie centrale du transposon. Comme chez pseudomonas sp. Kks102 les genes bphegf forment un groupe en amont des genes bpha1a2a3 et le gene bpha4 est separe de ces derniers par les genes bphbcd. Leur transcription est dependante d'une arn polymerase a o#-54. En utilisant le gene bphc comme gene rapporteur, nous avons montre que la region bph de tn4371 est bordee par des genes regulateurs qui dirigent l'expression du phenotype catabolique. Ces genes regulateurs semblent indispensables pour maintenir un niveau basal d'expression du gene bphc et augmenter ce niveau d'expression en presence de biphenyle. La region centrale de tn4371 apparait donc comme un module cataboliques complet forme de genes responsables du phenotype catabolique et de son expression. La translocation de l'element implique un processus d'excision/integration, ce qui rapproche tn4371 des tranposons conjugatifs usuellement rencontres chez les bacterie a gram+. L'appartenance a ce groupe a ete confirmee par la mise en evidence d'un gene d'integrase apparentee a celle du phage p22 et de genes de transfert apparentes aux genes tra des plasmides rp4 et ti. Comme les autres transposons du genre conjugatif, tn4371 existe transitoirement sous une forme ciruclaire ou ses deux extremites sont liees de maniere covalente. Tn4371 contient un second element transposable, lui-meme capable de se transferer du chromosome d'une souche donneuse vers le chromosome d'une souche receveuse. Tn4371 apparait donc comme un tranposon composite contenant differents modules fonctionnels: un module catabolique gouvernant la degradation du biphenyle, un module de transfert conjugatif porte par un second transposon, et un module de recombinaison site-specifique permettant l'integration de la structure circulaire dans le genome de l'hote