Identification et clonage du facteur 9g8, un nouveau membre de la famille des facteurs d'epissage riches en serines et arginines (sr). Etude des mecanismes de regulation de l'epissage alternatif

Identification and cloning of the 9g8 factor, a novel member of the family of splicing factors rich in serines and arginines (sr). Study of the regulation mechanisms of alternative splicing

• Auteur / Autrice : Yvon Cavaloc
• Direction : James Stévenin
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Résumé

Chez les eucaryotes superieurs, l'epissage alternatif des pre-mrna constitue un mode de regulation de l'expression des genes couramment utilise. Parmi les facteurs agissant en trans dans la regulation de l'epissage alternatif, on note une famille de 8 phosphoproteines, toutes constituees d'un domaine de liaison au rna en n-terminal et d'une region c-terminale riche en serines et arginines. Ces facteurs, appeles facteurs sr, sont necessaires a l'initiation de la reaction d'epissage constitutive et sont egalement impliques dans des processus de regulation de l'epissage alternatif. Nous avons clone le cdna et le gene d'un nouveau membre de cette famille, le facteur 9g8. Nous montrons que la proteine 9g8 possede toutes les caracteristiques physiques et fonctionnelles des autres facteurs sr. Cependant, dans la reaction d'epissage alternative in vitro, nous montrons que chacun des trois facteurs de 30-35 kda (asf/sf2, sc35 et 9g8) agit de maniere specifique. Par la technique de selex, nous montrons que ces facteurs sr reconnaissent des sequences riches en purines, voisines de celles deja identifiees et responsables de la reconnaissance des exons alternatifs, mais possedent toutefois une nette specificite dans l'interaction avec le rna. Nous nous sommes egalement interesses a la modulation de l'utilisation des sites 5' d'epissage du pre-mrna de l'unite e1a d'adenovirus au cours de l'infection virale. Nos resultats montrent que des facteurs sr sont titres au cours de l'infection par des transcrits viraux s'accumulant dans le noyau et que cette sequestration de facteurs est responsable de la modulation observee