Role de l'anticodon dans la specificite de reconnaissance des trnas methionine phenylalanine et isoleucine. Determinants de la formation intron-dependante des pseudouridines dans l'anticodon du trna#i#l#e mineur de levure

Role of the anticodon in the recognition of methionine, phenylalanine and isoleucine trnas. Intron-dependant formation fo pseudouridines in the anticodon of yeast minor isoleucine trna

• Auteur / Autrice : Bruno Senger
• Direction : Franco Fasiolo
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Résumé

La reconnaissance specifique du trna#m#e#t par la metrs de levure fait intervenir des determinants de structure primaire, secondaire et tertiaire, a savoir: la boucle anticodon et la base discriminatrice, le bras d et la conformation en l respectivement. Dans la deuxieme partie de ce travail, nous avons aborde l'etude de la reconnaissance entre un trna et son aminoacyl-trna synthetase sous un aspect evolutif. La phers mitochondriale de levure se distingue de son homologue cytoplasmique par un modele d'interaction enzyme-trna simplifie faisant appel a deux points de contacts majeurs: l'anticodon et le bras accepteur. Nous avons egalement analyse l'identite d'un trna#i#l#e ambre de levure dans un contexte bacterien in vivo demontrant que la paire u#3#0-g#4#0 dans le bras anticodon est capable de moduler l'identite et l'efficacite de suppression du trna. Enfin, nous avons etudie le role des bases modifiees i et psi en premiere position de l'anticodon des trna#i#l#e majeur et mineur de levure. Les effets de substitution de bases en position 34 de l'anticodon du trna#i#l#e par ordre decroissant donnent la hierarchie suivante: i psi > g u > a >> c suggerant que l'ilers reconnait une structure c=o n-h de la base 34 dependante d'une conformation particuliere de la boucle anticodon liee a la presence d'une autre base modifiee. D'autre part, les proprietes traductionnelles liees a la presence de psi#3#4, nous ont amene a etudier la biosynthese de ces psis dans l'anticodon du trna#i#l#e mineur. Nous avons montre qu'elle est: i) est intron dependante, ii) n'est pas sensible aux mutations ponctuelles dans la region de l'anticodon (positions 32 a 37), iii) ne requiert pas la structure tridimensionnelle du trna, iv) les deux psis en positions 34 et 36 sont probablement synthetisees par un meme enzyme