Les genes d'utilisation du tartrate d'agrobacterium vitis, analyse genetique et moleculaire

• Auteur / Autrice : PHILIPPE CROUZET
• Direction : Léon Otten
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)

Résumé

Agrobacterium vitis, qui est etroitement associee a la vigne, est la seule espece d'agrobacterie etudiee avec un spectre d'hote restreint. La capacite inhabituelle de ces souches d'utiliser preferentiellement le l(+)-tartrate par rapport au glucose a ete analysee car elle pourrait jouer un role dans la specificite d'hote: la vigne accumule des quantites inhabituellement importantes de l(+)-tartrate. La souche ab4 possede un plasmide conjugatif, le ptrab4, conferant l'utilisation du tartrate. L'etude dans un fond chromosomique heterologue de la region tar codant pour la croissance sur l(+)-tartrate a montre une organisation en un operon qui a ete appele ttu. Ttua code pour un activateur de transcription de type lysr transcrit constitutivement. Ttub, homologue de transporteurs, est necessaire pour l'entree du tartrate dans la bacterie. Ttuc code pour une tartrate deshydrogenase. Ttud catalyserait la seconde etape de degradation du tartrate. Ttue, homologue de pyruvate kinase, serait necessaire pour une croissance optimale sur tartrate. Si le fragment minimal d'utilisation du tartrate ttua-d permet la croissance d'une souche heterologue, il est insuffisant pour une utilisation normale de cette molecule dans le fond chromosomique originel d'a. Vitis. Il reduit meme sa capacite d'infecter la vigne. Des genes supplementaires sont necessaires. L'etude du cas particulier de la souche ab3 a revele la presence de deux regions tar independantes. L'une est portee par le plasmide ptrab3 et l'autre par le plasmide ptiab3. Les deux regions tar ont une organisation similaire a celle deja decrite pour l'operon ttu d'ab4. Une seconde copie fonctionnelle du gene de la tartrate deshydrogenase (ttuc') a ete trouvee. Elle est conservee parmi les a. Vitis. L'utilisation d'une region tar comme sonde indique que la plupart des isolats d'a. Vitis possedent un des trois types d'operon ttu decrit lors de ce travail