Méthodologie de la sélection pour la composition en acides gras de l'huile de colza (acide linolénique et acide érucique) : sélection précoce et marquage moléculaire

Breeding methodology for the modification of the fatty acid composition (linolenic and erucic acid) in rapeseed oil: early breeding and molecular tagging

• Auteur / Autrice : Christelle Garreau-Jourdren
• Direction : Michel Renard
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Rennes 1

Mots clés

Mots clés contrôlés

Impression moléculaire

Sélection végétale

Acide érucique

Acides linoléniques

Colza

Résumé

L'objectif de ce travail de these etait d'une part, d'evaluer les possibilites d'une selection precoce pour la teneur en acide linolenique (c18:3) de la graine, d'autre part de marquer par des techniques moleculaires les genes intervenant dans l'expression de la teneur en acide erucique (c22:1) et de la teneur en c18:3. La recherche d'estimateurs precoces de la teneur en acide linolenique de la graine a ete conduite principalement sur le pollen. La composition en acides gras du pollen et des graines de 80 haploides doubles issus d'un hybride f1 entre la variete stellar a faible teneur en c18:3 (3%) et la variete drakkar a forte teneur (8-10%) a ete examinee. Une correlation tres forte (r2>80%) a ete etablie, entre la teneur en c18:3 du pollen et celle des graines, et entre le taux de desaturation de l'acide linolenique en c18:3 du pollen et celui des graines. Les segregations observees sur pollen et sur graine sont similaires et confirment l'existence de 2 genes majeurs independants a effets additifs. Deux strategies de marquage moleculaire ont ete developpees: celle du marquage anonyme par rapd et celle du marquage d'un gene candidat. Le marquage moleculaire des genes controlant la teneur en c22:1 et en c18:3 a ete realise tout d'abord en utilisant des rapd, et la methode de bulk segregant analysis (bsa), a partir de deux descendances haploides doublees, une en disjonction pour la teneur en c22:1, l'autre pour la teneur en c18:3. Les quatre genes intervenant dans ces deux caracteres ont ete localises dans des groupes de liaison de 67 a 160cm contenant 6 a 10 marqueurs rapd. Chaque groupe correspond a un qtl majeur, avec deux qtls expliquant 28 et 56% de la variation phenotypique de la teneur en c22:1 et deux qtls expliquant 40 et 50% de la variation phenotypique de la teneur en c18:3. Ainsi une difference de contribution importante a ete mise en evidence entre les genes e1 et e2 controlant la teneur en c22:1, tandis que les genes l1 et l2 a permis d'etablir une liaison entre la teneur en c18:3 et le polymorphisme d'un gene fad3 de la 15 desaturase microsomale. Une bande de 1900 paires de base correspondant a l'amplification d'un segment d'adn genomique contenant 6 exons et 5 introns a pu etre obtenue. Apres digestion de cette bande par haeiii, le polymorphisme de longueur de trois des cinq fragments obtenus est lie au gene l1, correle a la teneur en c18:3