Determinisme et polymorphisme genetiques des sequences microsatellites de salmo trutta et d'autres salmonides. Comparaison avec le polymorphisme des locus enzymatiques

Genetic determinism and polymorphism of microsatellite sequences of salmo trutta and other salmonids. Comparison with the enzymatic polymorphism

• Auteur / Autrice : PABLO PRESA-MARTINEZ
• Direction : E. QUILLET
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1995
• Etablissement(s) : Paris 11

Résumé

Ce travail cherche a verifier l'interet des microsatellites pour les etudes de macrodifferenciation genetique chez salmo trutta. Les microsatellites a motif (gt)n sont plus abondantes que ceux a motif (ct)n, tous segreguent mendeliennement et leurs taux de recombinaison suggerant leurs distributions genomiques uniformes. Sept locus sur dix etudies, sont tres polymorphes. Densite, hypervariabilite et repartition aleatoire sont des caracteristiques tres interessantes pour la cartographie genique. Le haut polymorphisme suggerant que ces marqueurs sont plus sensibles que les enzymes a des fluctuations d'effectifs efficaces entre generations. Les modeles de mutation a pas de un (79%) et a pas de deux (14%), expliquent de facon coherente les distributions alleliques. La variabilite des microsatellites confirme les rapports de variabilite entre populations, detectes avec les enzymes. La plus haute variabilite genetique a ete observe dans les populations atlantiques et les souches domestiques. La variabilite genetique est environ cinq fois plus elevee pour les microsatellites que pour les enzymes. Les relations phenetiques sont congruents avec la structuration geographique de cette espece. Elles indiquent une dichotomie genetique entre les regions atlantique et mediterraneenne-orientale. Dans la mediterranee on distingue: salmo carpio, salmo trutta fario et salmo marmoratus. Dans l'atlantique on observe une dichotomie sud-est de l'europe et atlantique du nord. Les hautes valeurs de bootstrap entre populations suggerent une grande utilite des microsatellites en systematique a l'echelle fine. La conservation des amorces de s. Trutta chez s. Salar (100%) et chez o. Mykiss (70%), est un avantage majeur pour les etudes d'hybridation interspecifique, de cartographie comparee et en systematique des salmonides