Thèse soutenue

Organisation genomique de mycobacterium tuberculosis et de m. Bovis bcg

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Auteur / Autrice : WOLGANG PHILIPP
Direction : Stewart Thomas Cole
Type : Thèse de doctorat
Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
Date : Soutenance en 1995
Etablissement(s) : Paris 7

Résumé

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Mycobacterium tuberculosis, l'agent causant la tuberculose humaine est la premiere source de mortalite due a un agent infectieux. Depuis une decennie, le developpement et l'application des outils de la biologie moleculaire ont bien fait progresser la recherche sur cet organisme qui etait auparavant difficilement abordable. Dans ce memoire nous decrivons la construction des cartes genomiques d'une souche virulente de m. Tuberculosis, la souche de reference h37rv, ainsi que pour la souche vaccinale m. Bovis bcg pasteur. Une carte integree du genome de m. Tuberculosis h37rv a ete realisee a l'aide de l'electrophorese en champs pulses et de l'agencement de cosmides. Le chromosome de m. Tuberculosis d'une taille de 4,4 mb est legerement (50-100 kb) plus grand que celui de bcg mais possede 16 copies de l'element d'insertion is6110 alors qu'un seul exemplaire se trouve chez le bcg. Plus de 180 marqueurs genetiques ont ete localises sur le chromosome de m. Tuberculosis. La comparaison affinee de ces chromosomes mycobacteriens a montre une forte conservation mais a neanmoins conduit a l'identification de plusieurs regions restructurees ou ayant subi des deletions. L'etude comparative des genomes de m. Tuberculosis et de m. Leprae a revele un assemblage de facon mosaique avec certaines parties extremement bien conservees et d'autres organisees differemment. Pour le moment, huit regions conservees d'une taille entre 30 et 200 kb ont pu etre identifiees. Les outils mis au point lors de cette etude serviront de base au sequencage total du genome de m. Tuberculosis et aideront a identifier des parties genomiques impliquees dans le pouvoir pathogene mycobacterien