Etudes theoriques de sequences d'adn-b a repetitions di-et tetra-nucleotidiques : conformations et mecanique de deformations locales

par REZA THIERRY ELAIDI

Thèse de doctorat en Chimie

Sous la direction de Brigitte Hartmann.

Soutenue en 1995

à Paris 6 .


  • Résumé

    La reconnaissance selective de certaines sequences d'adn par les proteines ou les drogues depend de la conformation et de la flexibilite locale de la double helice. L'etude des effets de sequences sur la conformation de polymeres d'adn-b a repetitions di- et tetra-nucleotidiques a ete effectuee a l'aide du logiciel jumna en utilisant une nouvelle technique de cartographie adiabatique. L'etude des deformations concertees a ete abordee par l'analyse en composantes principales de ces cartes. Il a ete montre que chaque polymere pouvait adopter plusieurs sous-etats conformationnels stables dont le nombre est limite par la sequence. Par contre, certains parametres structuraux et les principales deformations qui leur sont liees sont independantes de la sequence des bases mais sont correlees aux conformations des sucres successifs. Une interpretation physique de ces deformations a ete proposee et procure une vision plus precise d'une mecanique generale aux oligomeres d'adn-b. Les resultats sont discutes en fonction des donnees experimentales

  • Titre traduit

    Theoretical studies of b-dna sequences with di-and tetra-nucleotidic symetry: conformations and mechanics of local deformations


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Informations

  • Détails : 252 P.
  • Annexes : 220 REF.

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  • Cote : PMC RT P6 1995

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