Surenroulement de l'adn et dynamique du nucleosome

Dna supercoiling and nucleosome dynamics

• Auteur / Autrice : VALERIE CAROT, P. COHEN
• Direction : Ariel Prunell
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1994
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Chez les eucaryotes, l'adn interagit avec les histones et les proteines non-histones pour former une superstructure nucleoproteique: la chromatine. Une des fonctions les plus evidentes de la chromatine est de permettre la condensation de l'adn dans le noyau. Plusieurs niveaux de compaction allant de l'adn au chromosome en metaphase ont ainsi ete distingues. Son role ne peut cependant etre restreint a cette seule fonction car les processus biologiques fondamentaux que sont la replication, la transcription, la recombinaison et la reparation s'operent au sein de la chromatine. La comprehension exacte de ces mecanismes requiert donc une connaissance approfondie de la structure et de la superstructure de la chromatine. Nous presentons dans l'introduction un apercu des connaissances actuelles sur la structure de la double helice. Cette structure conditionne en effet son interaction avec differentes proteines et en particulier les histones, avec lesquelles elle forme le nucleosome. La structure des nucleosomes sera presentee dans le second chapitre. Nous verrons par la suite comment ceux-ci peuvent influencer l'activite transcriptionnelle d'un gene. Nous avons montre que le surenroulement, en plus de ses effets deja connus sur la dynamique de l'adn et son interaction avec certaines proteines impliquees dans la transcription peut jouer egalement un role dans son interaction avec d'autres proteines, les histones, et particulierement au niveau d'une sequence strategique telle qu'un promoteur. Nos resultats montrent que le tetramere (h3-h4)2 est une structure douee d'une grande flexibilite conformationnelle. En effet, le tetramere surenroule preferentiellement l'adn en une superhelice gauche mais peut aussi, sous l'influence des fluctuations thermiques, surenrouler l'adn en une superhelice droite. Cet enroulement droit suggere un changement de structure du tetramere negatif au tetramere positif. La flexibilite conformationnelle du tetramere pourrait etre utilisee dans l'ensemble des processus impliquant l'adn dans la chromatine, et pourrait en particulier constituer la fameuse gyrase eucaryote