Pcr et variabilite genetique du virus de l'immunodeficience humaine de type 1

Pcr and genetic variability of the human immunodeficiency virus type 1

• Auteur / Autrice : Daniel Candotti
• Direction : Jean-Marie Huraux
• Type : Thèse de doctorat
• Discipline(s) : Sciences biologiques et fondamentales appliquées. Psychologie
• Date : Soutenance en 1994
• Etablissement(s) : Paris 6

Résumé

Nous avons etudie la variabilite genetique d'isolats primaires de vih-1, essentiellement d'origine congolaise, et ses repercussions sur le diagnostic de l'infection virale et l'efficacite des traitements therapeutiques et prophylactiques. La pcr et le sequencage direct des produits amplifies ont permis la caracterisation moleculaire rapide et simple d'une population virale. Nos resultats ont confirme le polymorphisme genetique particulierement important existant parmi les isolats africains de vih-1 (i) dans la region de chevauchement des genes gag et pol malgre la presence de nombreux sites critiques pour la replication virale ; (ii) dans la region du gene pol codant pour la transcriptase inverse et impliquee dans la resistance a l'azt ; (iii) dans la region du gene env codant pour la boucle v3 de la gp120 et impliquee dans la neutralisation. Une analyse fonctionnelle des genes pol et env a ete menee parallelement in vitro. Une correlation n'a pas toujours pu etre etablie entre le polymorphisme genetique des sites critiques et les proprietes de sensibilite des isolats a l'azt et a la neutralisation par des anticorps specifiques. La pcr s'est egalement averee efficace pour detecter l'infection virale in vitro chez l'humain et chez la souris scid humanisee. Dans certains cas cependant, la variabilite genetique du vih-1 compromettait l'efficacite de la pcr a visee diagnostique. L'ensemble des donnees recueillies montre qu'il est indispensable d'approfondir nos connaissances des relations existant entre structure genetique et fonctions virales avant de substituer une analyse genetique a une analyse fonctionnelle